データのメタデータ検索
| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ詳細 |
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| in situ hybridizationと組織免疫染色の顕微鏡画像リスト | Plabrain DB | 10.18908/lsdba.nbdc01108-003 |
プラナリア成体のWhole-mount in situ hybridizationによる遺伝子の発現部位の画像、および頭部の再生段階ごとの組織免疫染色による蛋白質の局在画像の一覧。画像ファイル自体は「in situ hybridizationと組織免疫染色の顕微鏡画像ファイル」のデータファイルから一括ダウンロードが可能である。 |
Whole-mount in situ hybridization、組織免疫染色 |
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データ詳細
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| PCRデータをマップしたFACSプロファイル画像 | Plabrain DB | 10.18908/lsdba.nbdc01108-002 |
DNA量 (縦軸 Hoechst33342)と細胞サイズ (横軸 CalceinAM)によりcell sortingをしたFACSプロファイルに、FACS-based single-cell PCRデータをマップした画像ファイル。各遺伝子を発現する細胞を青色のドットで表している。個々の画像は「FACS-based single-cell PCRデータ」の簡易検索の"FACS Profile"ボタンから閲覧できる。 |
FBSC-PCR （FACSを用いた半定量的single-cell PCR） |
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データ詳細
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| Main | PLACE | 10.18908/lsdba.nbdc00168-001 |
塩基配列情報。一つの塩基配列情報 (Main) に対して、一つ以上の文献情報 (Reference) が存在する。 |
Raw Data (ASCII format) のplace.seq から塩基配列情報を抽出し、CSVファイル (place_main.zip) を生成した。 |
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データ詳細
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| Raw Data (ASCII format) | PLACE | 10.18908/lsdba.nbdc00168-003 |
各シスエレメントの簡単な説明が含まれている、EMBL-likeフォーマットの文書。 |
高等植物遺伝子のプロモーター等の発現制御に関わる領域の塩基配列モチーフを論文から収集した。さらに、解説や文献、国際塩基配列データベースのアクセッション番号などを付加した。 |
データ詳細
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| Raw Data (FASTA format) | PLACE | 10.18908/lsdba.nbdc00168-005 |
各シスエレメントの簡単な説明が含まれている、FASTAフォーマットのデータ。 |
Raw Data (ASCII format) のplace.seq から必要な情報を抽出して生成した。 |
データ詳細
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| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データ取得方法 | 解析方法 | データ詳細 |