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データ名 データベース名 DOI 説明 データ取得方法 解析方法 データ詳細
Kagawa EST配列 Lotus japonicus EST index 10.18908/lsdba.nbdc00552-005

ミヤコグサ(Kagawa)の EST配列データ。1配列につき1ファイルのFasta形式。 FASTA形式のヘッダ部分に、AccessionとClone IDが記述される。データ件数は7,320件。

キャピラリーシーケンサー

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データ詳細 open_in_full
EST MAGEST 10.18908/lsdba.nbdc00128-003

マボヤESTの配列情報。 102,190件。

ABI PRISM 377 sequencer, Big-Dye dideoxy chain terminators

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データ詳細 open_in_full
クローン MAGEST 10.18908/lsdba.nbdc00128-002

マボヤの各発生段階から得られたcDNAクローンの情報。60,037件。

ホヤ受精卵を三田ら(Mita-Miyazawa et al., 1985)の方法で化学的にコリオン除去した後、 AGPCを用いてpoly(A) RNAを抽出(Chomczynski and Sacchi, 1987)し、 Oligotex-dT30ビーズ(Roche Japan, Tokyo)を用いて精製した。 5μgのpoly(A) RNAからoligo(dT)-primed cDNA libraryを作成した。 cDNAはlambda uni-ZAP cDNA synthesis kit (Stratagene)を用いて合成した後、精製した。

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データ詳細 open_in_full
コンティグ MAGEST 10.18908/lsdba.nbdc00128-001

マボヤESTをアセンブルして得られたコンセンサス配列のアノテーションや配列情報。11,299件。

EGassembler

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データ詳細 open_in_full
MassBank Raw Data MassBank 10.18908/lsdba.nbdc00298-002

各データ提供機関から収集されたマススペクトルデータ

各データ提供機関から、mass解析データを登録

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データ名 データベース名 DOI 説明 データ取得方法 解析方法 データ詳細