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データ名 データベース名 DOI 説明 データ取得方法 解析方法 データ詳細
YACクローンの挿入断片サイズ RGP physicalmap 10.18908/lsdba.nbdc00318-06-003

イネ物理地図におけるYACクローン毎の挿入断片サイズの一覧表

パルスフィールドゲル電気泳動(PFGE)によるゲル分別後、YACベクターをプローブとしたサザンハイブリダイゼーションでYACサイズを測定し、YAC番号順に並べました。

データ詳細 open_in_full
YACクローン情報 RGP physicalmap 10.18908/lsdba.nbdc00318-06-002

DNAマーカーで選抜されたYACクローン情報

RGPのDNAマーカーで選択されたYACクローンを一覧表示します。DNAマーカー名は「YACコンティグ情報」と表現が異なります。例えば、P0061とP61は同じマーカーを表します。
 
YACクローンデータの取得方法は下記を参照ください。
 
第1染色体:Wang et.al (1996), DNA Research, 3(5): 291-296.
第2染色体:Umehara et.al (1997), DNA Research, 4(2): 127-131.
第3、第11染色体:Tanoue et.al (1997), DNA Research, 4(2): 133-140.
第4、第7染色体:Koike et.al (1997), DNA Research, 4(1): 27-33.
第5染色体:Saji et.al (1996), DNA Research, 3(5): 297-302.
第6染色体:Umehara et.al (1996), Genome Research, 6(10): 935-942.
第8、第9染色体:Antonio et.al (1996), DNA Research, 3(6): 393-400.
第10、第12染色体:Shimokawa et.al (1996), DNA Research, 3(6): 401-406.

データ詳細 open_in_full
YACコンティグ情報 RGP physicalmap 10.18908/lsdba.nbdc00318-06-001

イネ染色体のYACコンティグ情報

染色体内の区分領域ごとにYACコンティグが含まれる範囲を表示します。DNAマーカー名は「YACクローン情報」と表現が異なります。例えば、P61とP0061は同じマーカーを表します。
 
YACクローンデータの取得方法は下記を参照ください。
 
第1染色体:Wang et.al (1996), DNA Research, 3(5): 291-296.
第2染色体:Umehara et.al (1997), DNA Research, 4(2): 127-131.
第3、第11染色体:Tanoue et.al (1997), DNA Research, 4(2): 133-140.
第4、第7染色体:Koike et.al (1997), DNA Research, 4(1): 27-33.
第5染色体:Saji et.al (1996), DNA Research, 3(5): 297-302.
第6染色体:Umehara et.al (1996), Genome Research, 6(10): 935-942.
第8、第9染色体:Antonio et.al (1996), DNA Research, 3(6): 393-400.
第10、第12染色体:Shimokawa et.al (1996), DNA Research, 3(6): 401-406.

データ詳細 open_in_full
サマリーテーブル RIKEN SSBC 10.18908/lsdba.nbdc01138-001

データベース中の7つのテーブルと2つのデータセットのまとめ。
LIMS風に実験の順序に沿ってまとめてある。
各種リンクから個々のテーブルやデータセットを閲覧できる。

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データ詳細 open_in_full
ドメイン RIKEN SSBC 10.18908/lsdba.nbdc01138-004

立体構造解析の対象としているタンパク質のドメインの情報。配列情報を含む。

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データ詳細 open_in_full
データ名 データベース名 DOI 説明 データ取得方法 解析方法 データ詳細