表現型観察データは、個々の表現型・変異体作出手法・変異体IDによって区別され、オントロジーで標準化されている。 ここで列挙されている観察情報は、変異体作出手法ごとにまとめられたオリジナルのデータベース(Ds tagging line / Ac activation tagging line/Fox-hunting line)に記載されている表現型観察データと１：１に対応している。

Ds tagging line, Ac activation tagging line, Fox-hunting line

表現型が発現するための実験条件(環境条件)です。 ・光条件など Plant Environment Ontology (EO)の語彙を用いて表現 ・特定の物質の存在・欠乏条件 ChEBIの語彙とプロパティを組み合わせて表現

Plant Environment Ontology, ChEBI

文献から収集された表現型には、形態的特徴、環境への応答性など様々なものがある。ここでは、それらの表現型がすべてオントロジータームとプロパティとの組み合わせで表現され、標準化されてリストされている。 形態に関する表現型は、原則的にPlant Ontology (PO)あるいはTrait Ontology (TO)の語彙とPhenotype Ontology (PATO)の語彙の組み合わせで表現される。PATOが「大きい」・「長い」などの性質、POがそれが現れる部位（器官名・組織名）および発育段階などをそれぞれ表す。生化学的な性質・ストレス耐性などの表現型はGene Ontology (GO), ChEBIなどのオントロジーも利用して表現する。 「長日条件」など、ある特定の環境条件で観察される表現型もある。その場合の環境条件は別のクラスにまとめられており、表現型情報からリンクされている。

Plant Ontology, Phenotype Ontology