| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データファイル ⇅ | 簡易検索URL ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ件数 ⇅ | データ詳細 |
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| 結晶観察画像 | RIKEN SSBC | 10.18908/lsdba.nbdc01138-003 |
結晶化スクリーニング実験データ。
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crystal | - |
自動結晶化・観察装置(TERA3、TERA、Crystal Farm)または結晶観察装置(CrystalEye) |
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353ディレクトリ 、画像ファイル 約50万件 |
データ詳細
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| 試料調製 | RIKEN SSBC | 10.18908/lsdba.nbdc01138-005 |
ドメインの発現に用いるプラスミドの情報(タグ切断後の配列情報を含む)、発現条件、生成条件と収量。 |
riken_ssbc_sample.zip
(8KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/riken_ssbc_plasmid |
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62件 |
データ詳細
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| Entire Sequence | RMG | 10.18908/lsdba.nbdc00193-002 |
イネミトコンドリアゲノムの全配列のデータです。全長490520bpです。この配列は、アクセッション番号AB076665, AB076666として国際塩基配列データベースに登録され、後に1つのアクセッション番号BA000029にまとめられています。RAP-DBの旧ゲノムブラウザにも収録されています。 |
rmg_seq.zip
(142 KB) |
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Kadowaki et al. (1996) に示す方法でミトコンドリアDNAを調製し、SauAIもしくはTspEIで断片化したショットガンライブラリのプラスミドクローンを、dideoxy法で配列決定しています。 |
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データ詳細
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| Genes (including RNA editing information) | RMG | 10.18908/lsdba.nbdc00193-003 |
イネミトコンドリアゲノムの遺伝子情報の一覧データです。
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rmg_gene.zip
(3 KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/rmg_gene |
本データベース中の「Entire Sequence」データ |
インターネットに公開されたDNAデータベースとのBLASTN, BLASTXアルゴリズムによる相同性検索、および、tRNAscan-SEプログラムを使った遺伝子予測を実施。
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81 件 |
データ詳細
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| Genomic Dynamism | RMG | 10.18908/lsdba.nbdc00193-007 |
イネを形作る3つのゲノム(ミトコンドリア、色素体、核)に共通する配列の一覧です。
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rmg_genomic_dynamism.zip
(1 KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/rmg_genomic_dynamism | 6 件 |
データ詳細
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| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データファイル | 簡易検索URL | データ取得方法 | 解析方法 | データ件数 | データ詳細 |
データのメタデータ一覧