データベースのメタデータ検索
| データベース名称 ⇅ | DOI ⇅ | データベース分類 ⇅ | 生物種 ⇅ | 説明 ⇅ | データベースの特長・有用性・活用方法 ⇅ | 運用場所 ⇅ | 利用許諾 ⇅ |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
HHDB
(生体水素水和水データベース) |
10.18908/lsdba.nbdc00495-000.V002 |
構造データベース-タンパク質構造
構造データベース-核酸構造
|
水素及び水和水を含むタンパク質や核酸の立体構造データ（中性子回折法や高分解能Ｘ線回折法による）に含まれる水素結合のデータベース。 |
各種グラフを用いた統計情報閲覧機能、3次元表示を用いた分子構造閲覧機能を持つ。（オリジナルサイトは休止中。またこれらの機能はアーカイブには含まれていない。） |
CC 表示-継承 | ||
| Mouse Basement Membrane Bodymap | 10.18908/lsdba.nbdc00574-000 |
タンパク質配列データベース-タンパク質の局在とターゲッティング
画像データベース
|
Mus musculus
(10090)
|
発生中のマウス胚における基底膜タンパク質の局在性を示す画像のデータベースです。数百枚のギガピクセル単位の高解像度バーチャルスライドを収録しています。これらの画像では、マウス全身の矢状断切片及び前頭断切片を免疫組織化学的に染色し、隣接する切片をヘマトキシリン/エオシンで染色しています。 |
さまざまな基底膜蛋白質の発現・局在を同一プラットフォームで染色してあり、臓器ごとに基底膜組成の比較が可能です。染色像は拡大・移動が自由にできるので、ユーザの興味のある部位での発現パターンが容易に観察できます。また、隣接切片のヘマトキシリン/エオシン染色像と連動させることができ、臓器の細胞形態を参照しながら観察可能です。 |
CC 表示-継承 </ br> | |
|
日化辞 InChI対応表
(日本化学物質辞書 InChI対応表) |
10.18908/lsdba.nbdc01530-01-000.V004 |
化合物データベース
|
日本最大級の化合物データベースである日本化学物質辞書（日化辞）の化合物IDのInChIおよびInChIKeyの対応データです。 |
InChIやInChIKeyは、国際純正・応用化学連合(IUPAC)などがその標準化と普及を目指している誰でもフリーで使用できる化合物の記述方法。InChIやInChIKeyをキーとすることで、化合物データベースの化合物ID間のマッピングが容易になります。 |
CC 表示 | ||
| YAKUZEN | 10.18908/lsdba.nbdc01605-000 |
薬膳レシピデータベース
|
食材が持つ効能 (性味,帰経など) と薬膳レシピのデータベースです。KNApSAcK Familyの1つです。 |
CC 表示-継承 | |||
|
PGDBj 登録生物種リスト・マーカーリスト・QTLリスト・DBリンク・ゲノム解析手法
(PGDBj Marker・Map・基本情報) |
10.18908/lsdba.nbdc01194-01-000.V003 |
植物データベース
塩基配列データベース
ゲノミクスデータベース (脊椎動物以外)
データベースカタログ
|
DNAマーカーと遺伝地図は、遺伝解析による有用遺伝子の同定やゲノム構造比較の他、マーカー選抜育種やDNA鑑定などの応用研究にも利用されます。本データベースでは、園芸作物を中心とした６５植物種について、DNAマーカー（６５生物種分）と、重要な農業形質に関わるQTLおよび地図情報（４５生物種分）を文献や外部データベースから収集・整理し、公開しました。また、８０植物種について、基本情報、ゲノム解析手法、関連ウェブサイトのリンク情報を収集・整理し、公開しました。 |
本データベースでは、病害抵抗性、環境ストレス耐性、収量などの形質に着目した情報整備を行っています。このため、これらをキーワードとしたDNAマーカーやQTLの検索が可能です。また、DNAマーカーを用いたタイピングの実験条件に関する情報収集と整備も行っており、利用者が有する材料で実験する際の条件検索も可能です。 |
CC 表示-継承 | ||
| データベース名称 | DOI | データベース分類 | 生物種 | 説明 | データベースの特長・有用性・活用方法 | 運用場所 | 利用許諾 |