データベース全般 | |
TP Atlas | |
ティーピー アトラス | |
Targeted Proteins Atlas | |
10.18908/lsdba.nbdc01161-000 | |
〒411-8540 静岡県三島市谷田1111 創薬等支援技術基盤プラットフォーム情報拠点 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 E mail: | |
代謝系/シグナル伝達経路 | |
ヒト、細菌(主に医学薬学に関連するもの)、各種モデル生物(マウス、シロイヌナズナ、イネ、酵母、ホヤ、キイロショウジョウバエ、カイコなど)。 | |
TP Atlasは、ターゲットタンパク研究の各課題につき、Cell Illustratorを使って表現したネットワーク図をプラットフォームとして、 そこに登場するターゲットタンパク質やその構造などの詳細情報や論文情報を引き出せる「ターゲットタンパク研究成果データベース」です。シグナル伝達ネッ トワーク、酵素反応経路、化合物代謝など多様な生命現象を対象とする、基本的生命、医薬、食品環境3分野の35課題を網羅しています。(Cell Illustratorは東大医科研 宮野悟教授らのグループが開発したパスウェイ描画ソフトウェアです。) | |
タンパク質間の相互関係、シグナル伝達経路などが研究テーマごとに模式的に示されており、ネットワーク図はダウンロードすることもできます。各タンパク質について、タンパク質の詳細情報(配列、構造)、遺伝子情報、文献情報へとリンクされています。ターゲットタンパク研究の各課題について、その背景、ハイライト、概要が簡潔にまとめられています。 | |
CC 表示-継承 詳細 | |
データベースのオリジナルサイト情報 | |
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 | |
http://www.tanpaku.org/tpatlas/ | |
2008年4月1日 | |
2012年3月31日 | |
http://www.tanpaku.org | |
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NCBI (NCBI Gene) UniProtKB (Protein Knowledgebase) GNP (Genome Network Platform) PDB (Protein Data Bank) タンパク3000構造ギャラリーへのリンクの成果表示 GNP におけるPPI PCI (タンパク質化合物相互作用データベース) | |
有り | |
有り | |
無し | |
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無し |