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このデータベースについて

Protein

データ説明

データ名

Protein

DOI

10.18908/lsdba.nbdc01161-002

データ内容の説明

各課題が扱うターゲットタンパク質の名称、シンボル、生物種、公共データベース（Entrez、UniProt等）へのリンク等の情報をまとめた一覧です。

データファイル

データファイル名 :

tp_atlas_protein.zip

データのURL :

https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/tp_atlas/LATEST/tp_atlas_protein.zip

ファイルサイズ :

49.8 KB

簡易検索URL

http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/tp_atlas_protein

データ取得方法

-

解析方法

-

データ件数

849 件

データ詳細

項目名	項目の説明
Project ID	課題ID
Sub Group	タンパク質のグループ
Symbol	タンパク質の簡易名称
Synonym	タンパク質の簡易名称の別名
Wiki	Wikipediaでの目的タンパク質の検索語
Full Name	タンパク質の名称 (機能的名称)
Other Names	タンパク質の別称
TaxId	生物名のTaxon identifer (簡易検索サイトではUniProt Taxonomyへのリンク)
Organism	タンパク質の生物名
Entrez	NCBI Gene ID (簡易検索サイトではNCBI Geneへのリンク)
UniProt	UniProt KBのaccession number
GNP	GNP (Genome Network Platform Viewer)のID (NCBI Gene ID)(簡易検索サイトではGNPへのリンク)
Struct. PDB	PDBj (Protein Data Bank Japan)の PDB ID (簡易検索サイトではPDBjへのリンク)
Struct. P3K	タンパク質3000構造ギャラリーのID (PDB ID) (簡易検索サイトではタンパク3000構造ギャラリーへリンク)
Struct. TPRP	TPRP (Targeted Proteins Research Program；TP構造ギャラリー) のID (PDB ID) (簡易検索サイトではTP構造ギャラリーにリンク）
PPI GNP	GNPにおけるタンパク質相互作用 (PPI) のID (NCBI Gene ID) (簡易検索サイトではPPIへのリンク)
PCI	PCI (タンパク質化合物相互作用データベース)のID (PDB ID) (簡易検索サイトではPCIへのリンク)
TP Article	PubMed ID (簡易検索サイトではPubMedへのリンク)
Press Release	TPプレスリリースのID (日付) (簡易検索サイトではTPプレスリリースへのリンク)