遺伝子発現データ - RefEx | LSDB Archive

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生命科学系データベースアーカイブ

RefEx

遺伝子発現データ

データ説明
データ名	遺伝子発現データ
DOI	-
データ内容の説明	EST, GeneChip, CAGE, RNA-seqの4種類の手法で測定された遺伝子発現データ。データ名は、原則として実験手法と組織分類等により以下のように決められている。 RefEx_expression_(実験手法)(組織分類数)_(生物種) 例：RefEx_expression_EST10_human などただし、CAGE法によるデータの一部は、以下のような名前になっている。 RefEx_expression_CAGE_all_(生物種) 例：RefEx_expression_CAGE_all_human など
データファイル	データファイル名: refex_expression01_cage10_human_prjdb1099.zip データのURL: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/refex/LATEST/refex_expression01_cage10_human_prjdb1099.zip ファイルサイズ: 908 KB データファイル名: refex_expression02_cage40_human_prjdb1099.zip データのURL: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/refex/LATEST/refex_expression02_cage40_human_prjdb1099.zip ファイルサイズ: 2.5 MB データファイル名: refex_expression03_cage_all_human_prjdb1099.zip データのURL: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/refex/LATEST/refex_expression03_cage_all_human_prjdb1099.zip ファイルサイズ: 40.5 MB データファイル名: refex_expression04_cage_all_mouse_prjdb1100.zip データのURL: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/refex/LATEST/refex_expression04_cage_all_mouse_prjdb1100.zip ファイルサイズ: 21.2 MB データファイル名: refex_expression05_est10_human.zip データのURL: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/refex/LATEST/refex_expression05_est10_human.zip ファイルサイズ: 597 KB データファイル名: refex_expression06_est10_mouse.zip データのURL: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/refex/LATEST/refex_expression06_est10_mouse.zip ファイルサイズ: 592 KB データファイル名: refex_expression07_est10_rat.zip データのURL: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/refex/LATEST/refex_expression07_est10_rat.zip ファイルサイズ: 421 KB データファイル名: refex_expression08_est40_human.zip データのURL: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/refex/LATEST/refex_expression08_est40_human.zip ファイルサイズ: 1.2 MB データファイル名: refex_expression09_est40_mouse.zip データのURL: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/refex/LATEST/refex_expression09_est40_mouse.zip ファイルサイズ: 1.1 MB データファイル名: refex_expression10_est40_rat.zip データのURL: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/refex/LATEST/refex_expression10_est40_rat.zip ファイルサイズ: 550 KB データファイル名: refex_expression11_genechip10_human_gse7307.zip データのURL: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/refex/LATEST/refex_expression11_genechip10_human_gse7307.zip ファイルサイズ: 1.1 MB データファイル名: refex_expression12_genechip10_mouse_gse10246.zip データのURL: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/refex/LATEST/refex_expression12_genechip10_mouse_gse10246.zip ファイルサイズ: 898 KB データファイル名: refex_expression13_genechip10_rat_gse952.zip データのURL: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/refex/LATEST/refex_expression13_genechip10_rat_gse952.zip ファイルサイズ: 143 KB データファイル名: refex_expression14_genechip40_human_gse7307.zip データのURL: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/refex/LATEST/refex_expression14_genechip40_human_gse7307.zip ファイルサイズ: 10.6 MB データファイル名: refex_expression15_genechip40_mouse_gse10246.zip データのURL: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/refex/LATEST/refex_expression15_genechip40_mouse_gse10246.zip ファイルサイズ: 2.8 MB データファイル名: refex_expression16_genechip40_rat_gse952.zip データのURL: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/refex/LATEST/refex_expression16_genechip40_rat_gse952.zip ファイルサイズ: 326 KB データファイル名: refex_expression17_rnaseq10_human_prjeb2445.zip データのURL: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/refex/LATEST/refex_expression17_rnaseq10_human_prjeb2445.zip ファイルサイズ: 1.9 MB データファイル名: refex_expression18_rnaseq10_mouse_prjna30467.zip データのURL: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/refex/LATEST/refex_expression18_rnaseq10_mouse_prjna30467.zip ファイルサイズ: 307 KB データファイル名: refex_expression19_rnaseq40_human_prjeb2445.zip データのURL: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/refex/LATEST/refex_expression19_rnaseq40_human_prjeb2445.zip ファイルサイズ: 3.2 MB データファイル名: refex_expression20_rnaseq40_mouse_prjna30467.zip データのURL: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/refex/LATEST/refex_expression20_rnaseq40_mouse_prjna30467.zip ファイルサイズ: 344 KB
簡易検索URL	http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/refex_data_relationship_matrix
データ取得方法	EST: NCBI UniGene GeneChip ヒト: GSE7307（Human body index - transcriptional profiling）マウス: GSE10246（GNF Mouse GeneAtlas V3）ラット: GSE952（Transcriptome analysis in rat） CAGE ヒト: PRJDB1099 (FANTOM5 Human CAGE) マウス: PRJDB1100 (FANTOM5 Mouse CAGE) RNA-seq ヒト: PRJEB2445 (RNA-Seq of human individual tissues and mixture of 16 tissues (Illumina Body Map)) マウス: PRJNA30467（Mapping and quantifying mammalian transcriptomes by RNA-Seq; brain, liver, muscle）
解析方法	https://github.com/dbcls/RefEx/tree/master/Rawdata_Processing
データ件数	-
データ詳細
-

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