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生命科学系データベースアーカイブ

PoSSuM

既知結合サイト

データ説明

info データ名 既知結合サイト
info DOI 
info データ内容の説明 

タンパク質上の結合サイトのうち、既知のものの情報です。

info データファイル 
データファイル名:
possum_ksite.zip
データのURL:
https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/possum/LATEST/possum_ksite.zip
ファイルサイズ:
7.9 MB
info 簡易検索URL -
info データ取得方法 

PDB

info 解析方法 -
info データ件数 

325,890件

データ詳細

項目名項目の説明
PocketIndex 結合サイトの内部ID
PDB_ID タンパク質のPDB ID
HET_Code 結合するリガンドのHETコード
ChainID 結合サイトのある鎖のID
HET_Res.No. リガンドの残基番号
ResLength サイトの残基数
Atoms リガンドの原子数
MolName サイトの分子名
EC サイトのEC ID
CATH サイトのCATH ID
SCOPe サイトのSCOPe ID
UniProt サイトのUniProt ID
UniRef50 サイトのUniRef50クラスタID（解析当時のもの）
GO1 サイトの分子機能を表すGene Ontology
GO2 サイトの分子機能を表すGene Ontology
GO3 サイトの分子機能を表すGene Ontology