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このデータベースについて

既知結合サイト

データ説明
データ名
既知結合サイト
DOI
10.18908/lsdba.nbdc01144-001
データ内容の説明
タンパク質上の結合サイトのうち、既知のものの情報です。
データファイル
データファイル名 :
possum_ksite.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
7.9 MB
簡易検索URL
-
データ取得方法

PDB

解析方法

-

データ件数

325,890件

データ詳細
項目名 項目の説明
PocketIndex

結合サイトの内部ID

PDB_ID

タンパク質のPDB ID

HET_Code

結合するリガンドのHETコード

ChainID

結合サイトのある鎖のID

HET_Res.No.

リガンドの残基番号

ResLength

サイトの残基数

Atoms

リガンドの原子数

MolName

サイトの分子名

EC

サイトのEC ID

CATH

サイトのCATH ID

SCOPe

サイトのSCOPe ID

UniProt

サイトのUniProt ID

UniRef50

サイトのUniRef50クラスタID(解析当時のもの)

GO1

サイトの分子機能を表すGene Ontology

GO2

サイトの分子機能を表すGene Ontology

GO3

サイトの分子機能を表すGene Ontology