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PGDBj - オルソログデータベース
Taxon (ラン藻)
データ説明
データ名
Taxon (ラン藻)
DOI
10.18908/lsdba.nbdc01194-02-006.V002
バージョン
V2
10.18908/lsdba.nbdc01194-02-006.V002
更新履歴
V1
10.18908/lsdba.nbdc01194-02-006.V001
-
データ内容の説明
ラン藻のオルソログクラスターの系統群に沿った再帰的な関係を示したデータ。
データファイル
データファイル名:
pgdbj_ortholog_db_cyanobacteria_taxon.zip
データのURL:
https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/pgdbj-ortholog-db/LATEST/pgdbj_ortholog_db_cyanobacteria_taxon.zip
ファイルサイズ:
7.4 KB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/pgdbj_ortholog_db_cyanobacteria_taxon
データ取得方法
生物種間の系統関係はNCBI Taxonomyデータベースから取得。
解析方法
-
データ件数
318 件
データ詳細
項目名
項目の説明
Taxonomy name
NCBI Taxonomy name
Taxonomy ID
NCBI Taxonomy ID
Taxonomy rank
NCBI Taxonomyのランク
Number of clusters
系統群に所属するクラスターの数
Number of proteins
系統群に所属するアミノ酸配列数
Higher taxon
1つ上位の系統群
Lower taxon
1つ下位の系統群
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