データ説明 | |
 データ名 | Genotype Data (Phase III) |
| DOI | 10.18908/lsdba.nbdc00036-006 |
| データ内容の説明 | D3（Phase III）の遺伝子型データ（876K SNP、87サンプル分）。 |
| データファイル | |
| 簡易検索URL | - |
| データ取得方法 | Affymetrix SNP 6.0 arrays によるジェノタイピング |
| 解析方法 | 全胞状奇胎(CHM)100検体をAffymetrix SNP 6.0 arrays でジェノタイピングした。アノテーションにはゲノム参照配列 NCBI Build36 を使用した。Kukita et al.(2010)に記載の方法に従って、蛍光シグナル比(log2R)が低値であったSNP、CNV解析により欠失領域にあると判定されたSNP、およびヘテロと判定されたSNPをノーコールに変換した。このあとサンプルコール率およびSNPコール率によるQCを行い最終的に87CHMについての876KSNPのタイピング結果を取得した。 |
| データ件数 | 876,399件 |
データ詳細 | |
