データ説明 | |
 データ名 | Genotype Data (Phase II) |
| DOI | 10.18908/lsdba.nbdc00036-005 |
| データ内容の説明 | D2（Phase II）の遺伝子型データ。 |
| データファイル | |
| 簡易検索URL | - |
| データ取得方法 | Perlegen 281K arrays、Affymetrix 500K arrays によるSNPジェノタイピング |
| 解析方法 | Perlegen 281K arraysによる解析については Kukita et al. (2005) に記載のとおりである。Affymetrix 500K arraysによる解析についてはHigasa et al. (2009) に記載されているが論文ではアノテーションにゲノム参照配列 NCBI Build36 を使用しているのに対し、D2では Build35 を使用しており、同じ参照配列を使用したPerlegen 281K arrays の結果と統合している。なお、タイピングの結果、1%以下の割合でヘテロと判定された箇所があるが、これらはエラー判定の可能性が高い（全胞状奇胎ではヘテロは基本的にないはずであり、実際にこれらのコールの再現性も悪い）のですべてノーコールに変換している。 |
| データ件数 | 581,235件 |
データ詳細 | |
