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TP Atlas
このデータベースについて

データベースの説明

データベース全般
名称
TP Atlas
名称の読み方
ティーピー アトラス
別名
Targeted Proteins Atlas
DOI
10.18908/lsdba.nbdc01161-000
作成者
作成氏名
宮本青
作成者英名
Sei Miyamoto
作成者所属
富士通株式会社
作成氏名
重元康昌
作成者英名
Yasumasa Shigemoto
作成者所属
富士通株式会社
作成氏名
紺野剛史
作成者英名
Takeshi Konno
作成者所属
富士通株式会社
作成氏名
水谷尚志
作成者英名
Hisashi Mizutani
作成者所属
国立遺伝学研究所
作成氏名
岩柳隆夫
作成者英名
Takao Iwayanagi
作成者所属
国立遺伝学研究所
作成氏名
菅原秀明*
作成者英名
Hideaki Sugawara
作成者所属
国立遺伝学研究所
連絡先

〒411-8540 静岡県三島市谷田1111

創薬等支援技術基盤プラットフォーム情報拠点 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所

E mail:

データベース分類

代謝系/シグナル伝達経路

データベースの説明

TP Atlasは、ターゲットタンパク研究の各課題につき、Cell Illustratorを使って表現したネットワーク図をプラットフォームとして、 そこに登場するターゲットタンパク質やその構造などの詳細情報や論文情報を引き出せる「ターゲットタンパク研究成果データベース」です。シグナル伝達ネッ トワーク、酵素反応経路、化合物代謝など多様な生命現象を対象とする、基本的生命、医薬、食品環境3分野の35課題を網羅しています。(Cell Illustratorは東大医科研 宮野悟教授らのグループが開発したパスウェイ描画ソフトウェアです。)

データベースの特長・有用性・活用方法

タンパク質間の相互関係、シグナル伝達経路などが研究テーマごとに模式的に示されており、ネットワーク図はダウンロードすることもできます。各タンパク質について、タンパク質の詳細情報(配列、構造)、遺伝子情報、文献情報へとリンクされています。ターゲットタンパク研究の各課題について、その背景、ハイライト、概要が簡潔にまとめられています。

データベースの利用許諾
CC 表示-継承 詳細
予算的背景・プロジェクト
-
論文等
文献名
TP Atlas: integration and dissemination of advances in Targeted Proteins Research Program (TPRP)-structural biology project phase II in Japan.
著者名
Iwayanagi T, Miyamoto S, Konno T, Mizutani H, Hirai T, Shigemoto Y, Gojobori T, Sugawara H.
雑誌名/掲載年月/号
J Struct Funct Genomics. 2012 Sep;13(3):145-54.
外部リンク
データベースのオリジナルサイト情報
データベース運用場所

情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所

オリジナルサイト
http://www.tanpaku.org/tpatlas/
運用開始年月日
2008年4月1日
最終更新年月日
2012年3月31日
統括サイト
http://www.tanpaku.org
データの一括ダウンロードサイト
-
参照先データベース

NCBI (NCBI Gene)

UniProtKB (Protein Knowledgebase)

GNP (Genome Network Platform)

PDB (Protein Data Bank)

タンパク3000構造ギャラリーへのリンクの成果表示

TP構造ギャラリー

PubMed

GNP におけるPPI

PCI (タンパク質化合物相互作用データベース)

一覧表示
有り
クエリ検索
有り
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無し
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