データベースの説明

データベース全般
名称	SSBD
名称の読み方	エスエスビーディー
別名	生命動態システム科学の統合データベース
DOI	10.18908/lsdba.nbdc01349-000
作成者	作成氏名遠里由佳子作成者英名 Yukako Tohsato 作成者所属理化学研究所生命システム研究センター発生動態研究チーム作成者の文献検索作成氏名ホーケネス作成者英名 Kenneth H. L. Ho 作成者所属理化学研究所生命システム研究センター発生動態研究チーム作成氏名京田耕司作成者英名 Koji Kyoda 作成者所属理化学研究所生命システム研究センター発生動態研究チーム作成氏名大浪修一* 作成者英名 Shuichi Onami 作成者所属理化学研究所生命システム研究センター発生動態研究チーム作成者の文献検索
連絡先	〒650-0047 神戸市中央区港島南町2-2-3 理化学研究所生命システム研究センター大浪修一 E-mail:
データベース分類	その他の分子生物学データベース
データベース分類	動態データベース
生物種	Taxonomy Name Mus musculus Taxonomy ID 10090 Taxonomy Name Drosophila melanogaster Taxonomy ID 7227 Taxonomy Name Caenorhabditis elegans Taxonomy ID 6239 Taxonomy Name Escherichia coli Taxonomy ID 562 Taxonomy Name Zebrafish Taxonomy ID 7955
データベースの説明	顕微鏡を活用した計測や数理モデリングで得られる時空間情報を数値として有する定量データのデータベースです。さまざまな生物の分子や細胞、個体の動態の定量データを収集・公開しており、格納されているデータはブラウザ上で多次元表示することができます。
データベースの特長・有用性・活用方法	定量データとそのメタ情報はBiological Dynamics Markup Language（BDML）形式のファイルとしてダウンロードできます。RESTful APIを介してSSBDの定量データを解析するクライアントアプリケーションを、プログラミング言語やプラットフォームに制限されることなく開発できます。さらには、定量データを可視化・解析するためのソフトウェアや、定量データの元となる動画像もダウンロードできます。
データベースの利用許諾	CC 表示-継承詳細
予算的背景・プロジェクト	名称ライフサイエンスデータベース統合推進事業統合化推進プログラム (H24-26年度)「生命動態システム科学のデータベースの統合化」ライフサイエンスデータベース統合推進事業統合化推進プログラム (H24-26年度)「生命動態システム科学のデータベースの統合化」
論文等	文献名 Biological Dynamics Markup Language (BDML): an open format for representing quantitative biological dynamics data 著者名 Koji Kyoda, Yukako Tohsato, Kenneth H. L. Ho, Shuichi Onami 雑誌名/掲載年月/号 Bioinformatics/2015年4月/Volume 31, Issue 7 外部リンク
データベースのオリジナルサイト情報
データベース運用場所	国立研究開発法人理化学研究所
オリジナルサイト	http://ssbd.qbic.riken.jp/
運用開始年月日	2013/9/3
最終更新年月日	2014/11/20
統括サイト	-
データの一括ダウンロードサイト	-
参照先データベース	Ensembl, WormBase, PubMed
一覧表示	無し
クエリ検索	有り
Webサービス	有り
WebサービスURL	http://ssbd.qbic.riken.jp/SSBD/api/v1/
ユーザ登録	無し