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RPSD
このデータベースについて

データベースの説明

データベース全般
名称
RPSD
名称の読み方
-
別名
イネタンパク質構造データベース
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00749-000
作成者
作成氏名
山崎俊正
作成者英名
Toshimasa Yamazaki
作成者所属
農業生物資源研究所
連絡先
〒305-8602 茨城県つくば市観音台2-1-2
国立研究開発法人 農業生物資源研究所
山崎俊正
E-mail : rpsd ad
データベース分類

構造データベース-タンパク質構造

生物種
Taxonomy Name
Oryza sativa
Taxonomy ID
Taxonomy Name
Arabidopsis thaliana
Taxonomy ID
Taxonomy Name
Sorghum bicolor
Taxonomy ID
Taxonomy Name
Zea mays
Taxonomy ID
Taxonomy Name
Hordeum vulgare
Taxonomy ID
Taxonomy Name
Triticum aestivum,
Taxonomy ID
Taxonomy Name
Glycine max
Taxonomy ID
データベースの説明

イネなど7種類の植物のタンパク質の立体構造を決定し、その成果と関連情報をまとめました。Protein Data Bankを情報源としたタンパク質の基本情報、構造決定に用いた実験手法、文献情報、配列、立体構造の画像等を掲載しています。

データベースの特長・有用性・活用方法

本研究では、イネ植物機能の総合的な解明と有用遺伝子の効率的な利用方策の開発に向けて、イネゲノムプロジェクトによって得られた遺伝子情報や完全長cDNA等を活用し、学術上または農業・産業上の重要性が想定される遺伝子について、「タンパク質の立体構造と機能/表現型」の相関と機能発現機構を原子レベルの分解能で解明することを目的としています。このサイトでは、タンパク質の立体構造を、植物ごとに一覧して検索できます。

データベースの利用許諾
CC 表示-継承 詳細
予算的背景・プロジェクト
名称
タンパク質の構造解析を利用した単離及び機能解明 (平成14-16年度、農業生物資源研究所)
論文等
-
データベースのオリジナルサイト情報
データベース運用場所

国立研究開発法人 農業生物資源研究所

※オリジナルサイト休止中

オリジナルサイト
-
運用開始年月日
-
最終更新年月日
2005/2/14
統括サイト
http://agrid.dna.affrc.go.jp/
データの一括ダウンロードサイト
-
参照先データベース
一覧表示
有り
クエリ検索
無し
Webサービス
無し
WebサービスURL
-
ユーザ登録
無し