RGP caps
このデータベースについて
データベースの説明
| データベース全般 | |
名称
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RGP caps
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名称の読み方
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別名
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RGP: 332 PCR-based genetic markers on rice chromosomes |
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DOI
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10.18908/lsdba.nbdc00318-05-000 |
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作成者
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作成氏名
山本 公子
作成者英名
Kimiko Yamamoto
作成者所属
農業生物資源研究所
作成氏名
呉 健忠
作成者英名
Jianzhong Wu
作成者所属
農業生物資源研究所
作成氏名
佐々木 卓治*
作成者英名
Takuji Sasaki
作成者所属
農業生物資源研究所
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連絡先
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〒305-8602 茨城県つくば市観音台2-1-2 国立研究開発法人 農業生物資源研究所 松本隆 E-mail :  片寄裕一 E-mail : 
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データベース分類
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植物データベース-イネ |
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データベース分類
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配列
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生物種
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データベースの説明
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我々は161個のsequence tagged site(STS)マーカーと171個のcleaved amplified polymorphic sequence (CAPS)マーカーを含む、332個のPCR法による遺伝マーカーを開発しました。このページではこれらマーカー情報を提供します。 |
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データベースの特長・有用性・活用方法
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STSマーカーやCAPSマーカーについての染色体上の位置、プライマー配列、増幅断片（日本晴）の大きさ、制限酵素といったあらゆる情報を表にまとめました。これらのマーカーは、日本晴（ジャポニカ種）とKasalath（インディカ種）間の多型検出のために開発されました。これらのマーカーによる多型検出は、品種または系統の組合せに依存しますが、他の組合せでの分析に利用することができます。
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データベースの利用許諾
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CC 表示-継承 詳細 |
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予算的背景・プロジェクト
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名称
第２期イネゲノム解析研究プロジェクト（平成10～16年）  |
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論文等
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| データベースのオリジナルサイト情報 | |
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データベース運用場所
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オリジナルサイト
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（公開停止中）http://rgp.dna.affrc.go.jp/E/publicdata/caps/index.html |
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運用開始年月日
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2002/02/10 |
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最終更新年月日
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2002/02/10 |
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統括サイト
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http://rgp.dna.affrc.go.jp/ |
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データの一括ダウンロードサイト
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参照先データベース
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一覧表示
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有り |
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クエリ検索
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無し |
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Webサービス
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無し |
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WebサービスURL
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ユーザ登録
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無し |