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このデータベースについて

Raw Data (ASCII format)

データ説明
データ名
Raw Data (ASCII format)
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00168-003
データ内容の説明
各シスエレメントの簡単な説明が含まれている、EMBL-likeフォーマットの文書。
データファイル
データファイル名 :
place.seq.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
110 KB
簡易検索URL
-
データ取得方法

高等植物遺伝子のプロモーター等の発現制御に関わる領域の塩基配列モチーフを論文から収集した。さらに、解説や文献、国際塩基配列データベースのアクセッション番号などを付加した。

解析方法

-

データ件数

469 件

データ詳細
項目名 項目の説明
ID

識別子

AC

アクセッション番号

DT

日付 (操作) 作成者

DE

説明 (制御、遺伝子、トランス作用因子など)

KW

キーワード

OS

生物種

RA

作成者

RT

タイトル

RL

文献データ

RC

分類基準 (DNase I フットプリント法 / 化学修飾 / ゲル遅延アッセイ / 相同性 / その他)

RD

外部データベース (MEDLINE番号、または、DDBJ/EMBL/GenBank アクセッション番号)

SQ

シスエレメントの配列
シスエレメントの配列には、A、G、C、T を表すために以下の記号を使用している (Mar. 31, 1997) 。
B: C, G or TD: A, G or TH: A, C or TK: G or TM: A or CN: A, C, G or TR: A or GS: C or GV: A, C or GW: A or TY: C or T

XX

データ種別の区切り