項目名 | 項目の説明 |
BARCODE |
使用したGeneChipを識別するためのバーコードです。CELファイル名の拡張子を除いた部分はこのBARCODEと一致します。ただし、「No ChipData」のデータは、遺伝子発現解析実験を行っておりませんので、対応するCELファイルはありません。 |
ARR_DESIGN |
GeneChipのデザイン名です。トキシコゲノミクスプロジェクトではHumanのチップはHG-U133_Plus_2、RatのチップはRat230_2を用いています。 |
EXP_ID |
実験セット毎に付けられたIDです。in vivo試験は0040~となっています。in vitro試験は5000番以降が付与されています。主にCOMPOUND_NAME、SPECIES、 EXP_TEST_TYPE、SINGLE_REPEAT_TYPEの組み合わせで定まります。 |
GROUP_ID |
群毎に付けられたIDです。01~16など二桁の数字が割り当てられています。主にDOSE_LEVEL、SACRIFICE_PERIODの組み合わせで定まります。 |
INDIVIDUAL_ID |
同一群内で、in vivo試験における個体、in vitro試験における試料に付けられたIDです。1から一桁の数字が割り当てられています。 |
ORGAN |
臓器の種類を表しています。LiverとKidneyの2種類が存在します。 |
MATERIAL_ID |
遺伝子発現データの取得に用いたサンプル切片を識別するためのIDです。Aから始まりB、Cという記号が付与されています。 |
COMPOUND_NAME |
化合物の名称です。 |
COMPOUND_ABBREVIATION |
化合物の略称です。 |
COMPOUND_NO |
化合物識別のために割り振った番号です。通し番号となっておらず欠番も存在します。 |
SPECIES |
生物種を表しています。 |
EXP_TEST_TYPE |
実験系(in vivo試験、in vitro試験)を表しています。 |
SINGLE_REPEAT_TYPE |
in vivo試験における投与回数(単回投与:Single、28日間反復投与:Repeat)を表しています。 |
SEX_TYPE |
性別を表しています。 |
STRAIN_TYPE |
in vivo試験におけるラットの系統を表しています。 |
ADMINISTRATION_ROUTE_TYPE |
化合物の投与経路を表しています。 |
ANIMAL_AGE(week) |
in vivo試験におけるラットの週齢を表しています。6週齢データのみが存在します。 |
SACRIFICE_PERIOD |
in vivo試験における屠殺時間、in vitro試験における曝露時間を表しています。 |
DOSE |
投与量を表しています。 |
DOSE_UNIT |
投与量の単位を表しています。 |
DOSE_LEVEL |
投与量のレベルを表しています。投与量の少ない順にControl、Low、Middle、Highとなっています。 |
臓器の重量 |
TERMINAL_BW(g) |
屠殺時の体重 |
LIVER(g) |
肝臓の重量 |
KIDNEY_TOTAL(g) |
腎臓の重量 |
KIDNEY_R(g) |
右腎の重量 |
KIDNEY_L(g) |
左腎の重量 |
血液学検査 |
RBC(x10_4/ul) |
赤血球数 |
Hb(g/dL) |
ヘモグロビン量 |
Ht(%) |
ヘマトクリット値 |
MCV(fL) |
平均赤血球容積 |
MCH(pg) |
平均赤血球血色素量 |
MCHC(%) |
平均赤血球血色素濃度 |
Ret(%) |
網赤血球率 |
Plat(x10_4/uL) |
血小板数 |
WBC(x10_2/uL) |
白血球数 |
Neu(%) |
好中球比 (白血球百分率) |
Eos(%) |
好酸球比 (白血球百分率) |
Bas(%) |
好塩基球比 (白血球百分率) |
Mono(%) |
単球比 (白血球百分率) |
Lym(%) |
リンパ球比 (白血球百分率) |
PT(s) |
プロトロンビン時間 |
APTT(s) |
活性化部分トロンボプラスチン時間 |
Fbg(mg/dL) |
フィブリノーゲン量 |
血液化学検査 |
ALP(IU/L) |
アルカリフォスファターゼ |
TC(mg/dL) |
総コレステロール |
TG(mg/dL) |
中性脂肪 |
PL(mg/dL) |
リン脂質 |
TBIL(mg/dL) |
総ビリルビン |
DBIL(mg/dL) |
直接ビリルビン |
GLC(mg/dL) |
グルコース |
BUN(mg/dL) |
血中尿素窒素 |
CRE(mg/dL) |
クレアチニン |
Na(meq/L) |
ナトリウム |
K(meq/L) |
カリウム |
Cl(meq/L) |
塩素 |
Ca(mg/dL) |
カルシウム |
IP(mg/dL) |
無機リン |
TP(g/dL) |
総蛋白質 |
RALB(g/dL) |
アルブミン |
A/G |
A/G比 (アルブミン・グロブリン比) |
AST(IU/L) |
アスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ |
ALT(IU/L) |
アラニンアミノトランスフェラーゼ |
LDH(IU/L) |
乳酸脱水素酵素 |
GTP(IU/L) |
γグルタミルトランスペプチダーゼ |
細胞生存率 |
DNA(%) |
DNA含量を基に算出した相対生存率 |
LDH(%) |
培養上清中に漏出したLDHの活性値を基に算出した相対生存率 |