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このデータベースについて

Mapping Pseudomolecule data

データ説明
データ名
Mapping Pseudomolecule data
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00120-005
データ内容の説明
TIGR japonica Pseudomoleculesとのマッピング情報
データファイル
データファイル名 :
kome_mapping_pseudomolecule_data.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
719 KB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/kome_mapping_pseudomolecule_data
データ取得方法

-

解析方法

TIGR japonica Pseudomoleculesに対して完全長cDNAクローンのマッピングを行った。

データ件数

30,892 件

データ詳細
項目名 項目の説明
 ACCESSION_NO

 完全長cDNAクローンのアクセッション番号

 CLONE_NAME

 完全長cDNAクローンの名称

 HIT_NUMBER

 cDNAクローンのマッピングサイト数

 PSEUDOMOLECULE

 マッピングされたpseudomoleculeの名称

 CHROMOSOME

 マッピングされたpseudomoleculeの染色体番号

 CHR_START_POS

 pseudomolecule上のアラインメント開始位置

 CHR_END_POS

 pseudomolecule上のアラインメント終端位置

 CDNA_START_POS

 cDNA上のアラインメント開始位置

 CDNA_END_POS

 cDNA上のアラインメント終端位置

 STRAND

 マッピングされたcDNAストランドの向き

 TU_ID

 マッピングされたTU(Transcriptional Unit)のID