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このデータベースについて

Mapping data detail

データ説明
データ名
Mapping data detail
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00120-004
データ内容の説明
ジャポニカ種のIRGSPイネゲノム配列との詳細なマッピング情報
データファイル
データファイル名 :
kome_mapping_data_detail.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
2.3 MB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/kome_mapping_data_detail
データ取得方法

-

解析方法

ジャポニカ種のIRGSPイネゲノムBACコンティグに対して完全長cDNAクローンのマッピングを行った。

データ件数

154,484 件

データ詳細
項目名 項目の説明
 ACCESSION_NO

 完全長cDNAクローンのアクセッション番号

 CLONE_NAME

 完全長cDNAクローンの名称

 BAC_ACCESSION_NO

 マッピングされたBACのアクセッション番号

 CHROMOSOME

 マッピングされたBACの染色体番号

 BAC_START_POS

 BAC上のエキソン開始位置

 BAC_END_POS

 BAC上のエキソン終端位置

 CDNA_START_POS

 cDNA上のエキソン開始位置

 CDNA_END_POS

 cDNA上のエキソン終端位置

 STRAND

 マッピングされたcDNAストランドの向き

 TU_ID

 マッピングされたTU(Transcriptional Unit)のID