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このデータベースについて

Tos17 link result

データ説明
データ名
Tos17 link result
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00120-014
データ内容の説明
Tos17ミュータントクローンとの対応情報
データファイル
データファイル名 :
kome_tos17_link_result.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
49 KB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/kome_tos17_link_result
データ取得方法

イネミュータントパネルデータベースで公開されているTos17ミュータント隣接塩基配列を使用。

解析方法

Tos17隣接塩基配列、完全長クローンをイネゲノムBACコンティグにマッピングし、互いに重複した部分があるものを対応していると予測した。
マッピングのためには閾値1e-100でBlastn検索を行った。

データ件数

2,864 件

データ詳細
項目名 項目の説明
 ACCESSION_NO

 完全長cDNAクローンのアクセッション番号

 FULL_CLONE_NAME

 完全長cDNAクローンの名称

 TOS_NAME

 Tos17クローン名

 BAC_ACCESSION_NO

 マッピングされたBACのアクセッション番号

 TOS_INSERT_POSITION

 BAC上のTos17クローンの挿入位置

 cDNA_START_POSITION

 cDNA上のTos17クローンの開始位置

 cDNA_END_POSITION

 cDNA上のTos17クローンの終端位置