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このデータベースについて

RMOS blastn result

データ説明
データ名
RMOS blastn result
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00120-013
データ内容の説明
コメESTマイクロアレイ(G-アレイ)に対してblastn検索した結果
データファイル
データファイル名 :
kome_rmos_blastn_result.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
74 KB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/kome_rmos_blastn_result
データ取得方法

Rice Microarray Opening Site (RMOS)で公開されているイネゲノムデータを使用。

解析方法

コメESTマイクロアレイ(G-アレイ)に対してblastn検索(blast2.2.12)を行った。(上部ヒットのみ)
閾値は1e-10とし、最も相同性が高かったものを表示している。

データ件数

5,024 件

データ詳細
項目名 項目の説明
 ACCESSION_NO

 完全長cDNAクローンのアクセッション番号

 CLONE_NAME

 完全長cDNAクローンの名称

 ARRAY_ELEMENT

 G-Arrayプローブのエレメント

 PROBE_ACCESSION

 G-Arrayプローブのアクセッション番号

 PROBE_CLONE_NAME

 G-Arrayプローブのクローン名

 EXPECT

 blastn検索の期待値

 SCORE

 blastn検索のスコア