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このデータベースについて

InterProScan検索結果

データ説明
データ名
InterProScan検索結果
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00951-004
データ内容の説明
クラスタの代表的ESTに対して、InterProScanを行った結果の一覧です。
データファイル
データファイル名 :
kaiko_cdna_interpro.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
3.1 MB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/kaiko_cdna_interpro
データ取得方法

「ORF情報」データ

解析方法

クラスタの代表的ESTのORFに対して、InterProで検索した結果による注釈(アノテーション)を付けています。

データ件数

112,731 件

データ詳細
項目名 項目の説明
Rep ID

代表的ESTのアクセション番号

ORF Name

ORFの名前

CRC64

各配列におけるCRC64の値

Length

配列の長さ (bp)

Analysis

解析プログラム

Signature Accession

モチーフのaccession

Signature Description

モチーフのdescription

Start location

モチーフの開始位置

Stop location

モチーフの終了位置

Score

機能部位配列への一致度のE-value

Status

機能部位配列との一致状況のステータス (“T”=一致)

InterPro accession

InterProアノテーションのaccession

InterPro description

InterProアノテーションのdescription

GO terms

GOターム