- あのデータベースが、丸ごとダウンロード可能に!-
[ Japanese | English ]
このデータベースについて

クラスタ一覧

データ説明
データ名
クラスタ一覧
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00951-002
データ内容の説明
各クラスタにおいて、各クラスタに属する配列の総数と、ライブラリごとに分けた配列の数の一覧です。
データファイル
データファイル名 :
kaiko_cdna_cluster.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
453 KB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/kaiko_cdna_cluster
データ取得方法

「EST詳細」データ

解析方法

100bpより長い領域でidentityが95%より大きいクローン同士を同じクラスタとしました。また、各クラスタに属するクローン数をライブラリごとに分けました。

データ件数

59,729 件

データ詳細
項目名 項目の説明
Rep ID

各クラスタの代表的ESTのアクセション番号

Cluster Size

各クラスタの全クローン件数

an--

an--のクローン件数

bmmt

bmmtのクローン件数

bmov

bmovのクローン件数

bmte

bmteのクローン件数

BmN-

BmN-のクローン件数

br--

br--のクローン件数

brP-

brP-のクローン件数

brS-

brS-のクローン件数

caL-

caL-のクローン件数

ce--

ce--のクローン件数

ceN-

ceN-のクローン件数

cesb

cesbのクローン件数

dpe-

dpe-のクローン件数

e100

e100のクローン件数

e4

e4のクローン件数

e96h

e96hのクローン件数

epM-

epM-のクローン件数

epV3

epV3のクローン件数

F1mg

F1mgのクローン件数

famL

famLのクローン件数

fbf

fbfのクローン件数

fbm

fbmのクローン件数

fbpv

fbpvのクローン件数

fbS2

fbS2のクローン件数

fcaL

fcaLのクローン件数

fcP8

fcP8のクローン件数

fe8d

fe8dのクローン件数

ffbm

ffbmのクローン件数

FJsb

FJsbのクローン件数

fmgV

fmgVのクローン件数

fner

fnerのクローン件数

ftes

ftesのクローン件数

fufe

fufeのクローン件数

fwgP

fwgPのクローン件数

heS0

heS0のクローン件数

heS3

heS3のクローン件数

J150

J150のクローン件数

JFsb

JFsbのクローン件数

maV3

maV3のクローン件数

MFB-

MFB-のクローン件数

mg

mgのクローン件数

msgV

msgVのクローン件数

MSV3

MSV3のクローン件数

mxg-

mxg-のクローン件数

n

nのクローン件数

Nnor

Nnorのクローン件数

NRPG

NRPGのクローン件数

NV02

NV02のクローン件数

NV06

NV06のクローン件数

NV12

NV12のクローン件数

ovS0

ovS0のクローン件数

ovS3

ovS3のクローン件数

P5PG

P5PGのクローン件数

pg--

pg--のクローン件数

phe-

phe-のクローン件数

prgv

prgvのクローン件数

prW-

prW-のクローン件数

ps4M

ps4Mのクローン件数

psV3

psV3のクローン件数

PSV3

PSV3のクローン件数

tesS

tesSのクローン件数

tesV

tesVのクローン件数

vg4M

vg4Mのクローン件数

wd--

wd--のクローン件数

wdV1

wdV1のクローン件数

wdV3

wdV3のクローン件数

ws0

ws0のクローン件数

ws2

ws2のクローン件数

ws3

ws3のクローン件数

wv4

wv4のクローン件数

swa

swaのクローン件数

swb

swbのクローン件数

swc

swcのクローン件数

swd

swdのクローン件数

swe

sweのクローン件数

swf

swfのクローン件数

swg

swgのクローン件数

swh

swhのクローン件数

swj

swjのクローン件数

swk

swkのクローン件数

swl

swlのクローン件数

swp

swpのクローン件数

BmP

BmPのクローン件数

L1

L1のクローン件数

L2

L2のクローン件数

L3

L3のクローン件数

L4

L4のクローン件数

L5

L5のクローン件数

L6

L6のクローン件数

L7

L7のクローン件数

L8

L8のクローン件数

L9

L9のクローン件数

L10

L10のクローン件数

L11

L11のクローン件数

L12

L12のクローン件数

L13

L13のクローン件数

L14

L14のクローン件数

L15

L15のクローン件数

L16

L16のクローン件数

Other

その他ライブラリのクローン件数