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このデータベースについて

fRNAdbサマリ

データ説明
データ名
fRNAdbサマリ
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00452-001
データ内容の説明
機能性RNAデータベースは、文献で報告された機能性RNAを収集し、塩基配列、ゲノム位置、2次構造、文献情報などと関連付けてカタログ化したものである。
データファイル
データファイル名 :
frnadb_summary.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
46.5 MB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/frnadb_summary
データ取得方法

RNA情報は文献および既存データベースからの収集による。ゲノム位置、2次構造は計算機による予測による。文献情報は、RNAファミリ名を題名・要旨に含むものを検索したものである。

解析方法

-

データ件数

510,055 件

データ詳細
項目名 項目の説明
ID

エントリのID

Accession

アクセション番号

Description

説明

SO name

配列オントロジーによる分類

Organism

生物種

Xref

クロスリファレンス情報

Length

配列長

Sequence

配列

Second Structure Thumbnail

RNA二次構造画像のサムネイル

Second Structure (PNG)

RNA二次構造画像(PNG形式)

Second Structure (PDF)

RNA二次構造画像(PDF形式)