データベースの説明

データベース全般
名称	ChIP-Atlas
名称の読み方	チップアトラス
別名	-
DOI	10.18908/lsdba.nbdc01558-000.V020
作成者	作成氏名沖真弥* 作成者英名 Shinya Oki 作成者所属京都大学作成者の文献検索作成氏名大田達郎作成者英名 Tazro Ohta 作成者所属ライフサイエンス統合データベースセンター
連絡先	〒606-8507 京都市左京区聖護院川原町53 メディカルイノベーションセンター棟 3F 京都大学大学院医学研究科創薬医学講座特定准教授　沖真弥 E-mail:
データベース分類	塩基配列データベース-転写調節部位、転写因子ゲノミクスデータベース（脊椎動物以外）-ゲノムアノテーション用語、オントロジー、命名法ヒト/その他の脊椎動物ゲノム-ヒトゲノムデータベース/マップ/ビューワ
生物種	Taxonomy Name Homo sapiens Taxonomy ID 9606 Taxonomy Name Mus musculus Taxonomy ID 10090 Taxonomy Name Drosophila melanogaster Taxonomy ID 7227 Taxonomy Name Caenorhabditis elegans Taxonomy ID 6239 Taxonomy Name Saccharomyces cerevisiae Taxonomy ID 4932 Taxonomy Name Rattus norvegicus Taxonomy ID 10116
データベースの説明	ChIP-Atlas は Sequence Read Archive で公開されている既報のChIP-Seqデータを再解析することによって様々な解析結果を提供し、またユーザデータの解析を可能にするデータベースおよびそのウェブインターフェースである。データ登録者によって記述されたメタデータを再整理することによって、データを組み合わせた様々な結果を提供している。詳しくは https://github.com/inutano/chip-atlas/wiki を参照のこと。
データベースの特長・有用性・活用方法	ChIP-Atlas を利用することにより、既報の ChIP-Seq データのピーク情報をゲノムブラウザで閲覧したり、転写因子が制御している遺伝子を調べたり、共局在因子を調べたり、ユーザデータを入力としたエンリッチメント解析を行うことができる。
データベースの利用許諾	CC 表示-継承詳細
予算的背景・プロジェクト	名称 JST NBDC 平成２７年度統合化推進プログラム（統合データ解析トライアル）名称 JST NBDC 平成２９年度統合化推進プログラム
論文等	-
データベースのオリジナルサイト情報
データベース運用場所	京都大学大学院医学研究科創薬医学講座
オリジナルサイト	https://chip-atlas.org/
運用開始年月日	2015/12/01
最終更新年月日	2021/09/21
統括サイト	-
データの一括ダウンロードサイト	https://github.com/inutano/chip-atlas/wiki#downloads_doc
参照先データベース	-
一覧表示	有り
クエリ検索	有り
Webサービス	無し
WebサービスURL	-
ユーザ登録	無し