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生命科学系データベースアーカイブ

SAHG

タンパク質基本情報

データ説明

info データ名 タンパク質基本情報
info DOI 
info データ内容の説明 

アミノ酸配列やRefSeq IDなど、モデリング対象タンパク質の基本情報

info データファイル 
データファイル名:
sahg_protein.zip
データのURL:
https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/sahg/LATEST/sahg_protein.zip
ファイルサイズ:
8.1 MB
info 簡易検索URL 
info データ取得方法 

RefSeq (NCBI Reference Sequence Database)から取得。その他、EzCatDB (A Database of Enzyme Catalytic Mechanisms), Human Protein Reference Database (HPRD), UniProtKB/Swiss-Protの各データベースへの配列検索結果を取得。

info 解析方法 

-

info データ件数 

24,878 件

データ詳細

項目名項目の説明
RefSeqID RefSeq ID
domainSize リンクしているドメインモデリングの数
Link to Domain （簡易検索ページのみ）同一RefSeqIDのドメインモデリングへのリンク
Link to Complex （簡易検索ページのみ）同一RefSeqIDの複合体モデリングへのリンク
GeneID タンパク質をコードする遺伝子Entrez Gene ID
Definition RefSeqに記述されているタンパク質名称
chromosome タンパク質をコードする遺伝子が存在する染色体番号
Location タンパク質をコードする遺伝子の遺伝子座
Sequence アミノ酸配列
EC number EC番号
EzCatDB EzCatDB ID
HPRD HPRD ID
Swiss-Prot （簡易検索ページのみ）UniProtKB/Swiss-Protへのリンク