- あのデータベースが、丸ごとダウンロード可能に!-
[ Japanese | English ]
RGP estmap2001
このデータベースについて

データベースの説明

データベース全般
名称
RGP estmap2001
名称の読み方
-
別名
RGP : A YAC-Based Rice Transcript Map Containing 6591 EST Sites
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00318-04-000
作成者
作成氏名
呉 健忠
作成者英名
Jianzhong Wu
作成者所属
農業生物資源研究所
作成氏名
松本 隆
作成者英名
Takashi Matsumoto
作成者所属
農業生物資源研究所
作成氏名
佐々木 卓治*
作成者英名
Takuji Sasaki
作成者所属
農業生物資源研究所
連絡先
〒305-8602 茨城県つくば市観音台2-1-2
国立研究開発法人 農業生物資源研究所
松本隆
E-mail : rgp_estmap2001_address
片寄裕一
E-mail : rgp_estmap2001_address2
データベース分類

植物データベース-イネ

データベース分類

ゲノム
配列

生物種
Taxonomy Name
Oryza sativa
Taxonomy ID
データベースの説明

このデータベースは、「Wu et al, Plant Cell 14, 2002」に掲載したYACベースのイネ転写産物地図に関する情報を提供しています。イネ転写産物地図作成に使用された6,591個のEST部位情報が含まれています。

データベースの特長・有用性・活用方法

表や図(ダウンロード用のMicrosoft ExcelフォーマットおよびPDFフォーマットあり)の形式で、YACベースのイネ転写産物地図の詳細を提供します。表には、クローン特異的なESTプライマーを用いた、PCR法によるYACスクリーニングの詳細な結果が含まれています。 図には、割り当てられたEST部位でのイネの遺伝地図、および、YAC物理地図が含まれています。
このアーカイブは下記の最終更新日のデータを元に作成されており、現状とは必ずしも一致しない場合があります。

データベースの利用許諾
CC 表示-継承 詳細
予算的背景・プロジェクト
名称
第2期イネゲノム解析研究プロジェクト(平成10~16年)
論文等
文献名
A comprehensive rice transcript map containing 6591 expressed sequence tag sites.
著者名
Wu J, Maehara T, Shimokawa T, Yamamoto S, Harada C, Takazaki Y, Ono N, Mukai Y, Koike K, Yazaki J, Fujii F, Shomura A, Ando T, Kono I, Waki K, Yamamoto K, Yano M, Matsumoto T, Sasaki T.
雑誌名/掲載年月/号
The Plant Cell / 2002 Mar / 14(3):525-535
外部リンク
データベースのオリジナルサイト情報
データベース運用場所
オリジナルサイト
(公開停止中)http://rgp.dna.affrc.go.jp/E/publicdata/estmap2001/index.html
運用開始年月日
2002/02/16
最終更新年月日
2002/02/16
統括サイト
http://rgp.dna.affrc.go.jp/
データの一括ダウンロードサイト
-
参照先データベース

MAFF_Rice cDNA Clone
DDBJ

一覧表示
有り
クエリ検索
無し
Webサービス
無し
WebサービスURL
-
ユーザ登録
無し