組織10/40分類表

データ説明

データ名

組織10/40分類表

DOI

データ内容の説明

RefExで用いている組織分類の一覧。
サンプルIDの項目については、GeneChipのデータではGSM_#が、RNA-SeqデータではSINGLE, PAIREDが記載されている。

データファイル

データファイル名:

refex_10_40_classifications01_genechip_human_gse7307.zip

データのURL:

https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/refex/LATEST/refex_10_40_classifications01_genechip_human_gse7307.zip

ファイルサイズ:

3 KB

データファイル名:

refex_10_40_classifications02_genechip_mouse_gse10246.zip

データのURL:

https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/refex/LATEST/refex_10_40_classifications02_genechip_mouse_gse10246.zip

ファイルサイズ:

1 KB

データファイル名:

refex_10_40_classifications03_genechip_rat_gse952.zip

データのURL:

https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/refex/LATEST/refex_10_40_classifications03_genechip_rat_gse952.zip

ファイルサイズ:

1 KB

データファイル名:

refex_10_40_classifications04_rnaseq_human_prjeb2445.zip

データのURL:

https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/refex/LATEST/refex_10_40_classifications04_rnaseq_human_prjeb2445.zip

ファイルサイズ:

1 KB

データファイル名:

refex_10_40_classifications05_rnaseq_mouse_prjna30467.zip

データのURL:

https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/refex/LATEST/refex_10_40_classifications05_rnaseq_mouse_prjna30467.zip

ファイルサイズ:

1 KB

簡易検索URL

http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/refex_data_relationship_matrix

データ取得方法

解析方法

データ件数

データ詳細

項目名	項目の説明
Description (RefEx refined)	組織の名前
10 groups	組織10分類における各組織のID
40 groups	組織40分類における各組織のID
GSM_#	各組織のデータの算出に用いたサンプルのID。複数あるものはすべて記載している。
SINGLE	シングルエンドRNA-Seqのデータ
PAIRED	ペアエンドRNA-Seqのデータ

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