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このデータベースについて

(Drug Search)既知サイト間相同性データ

データ説明
データ名
(Drug Search)既知サイト間相同性データ
DOI
10.18908/lsdba.nbdc01144-009
データ内容の説明
(Drug Search)クエリサイトとターゲットサイトの中で、既知の結合サイト間の相同性を示すデータです。
データファイル
データファイル名 :
possum_binding_sites_known_similarity.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
2.4 MB
簡易検索URL
https://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/possum_binding_sites_known_similarity
データ取得方法

PDB

解析方法

-

データ件数

50,626件

データ詳細
項目名 項目の説明
Q:PocketIndex

クエリサイトの内部ID

T:PocketIndex

ターゲットサイトの内部ID

Q:PDB_ID

クエリサイトのPDB ID

T:PDB_ID

ターゲットサイトのPDB ID

Q:HET_Code

クエリサイトのHETコード

T:HET_Code

ターゲットサイトのHETコード

Q:ChainID

クエリサイトのある鎖のID

T:ChainID

ターゲットサイトのある鎖のID

Q:Res.No.

クエリサイトのアミノ酸残基番号

T:Res.No.

ターゲットサイトのアミノ酸残基番号

AlignedLength

アミノ酸アライメント長

RMSD

平均二乗偏差

AminoIdentity

アミノ酸の一致率

Q:MolName

クエリの分子名

T:MolName

ターゲットの分子名

Q:EC

クエリのEC ID

T:EC

ターゲットのEC ID

Q:CATH

クエリのCATH ID

T:CATH

ターゲットのCATH ID

Q:SCOPe

クエリのSCOPe ID

T:SCOPe

ターゲットのSCOPe ID

Q:UniProt

クエリのUniProt ID

T:UniProt

ターゲットのUniProt ID

Q:UniRef50

クエリのUniRef50クラスタID(解析当時のもの)

T:UniRef50

ターゲットのUniRef50クラスタID(解析当時のもの)

EC_Df

クエリとターゲットのEC IDの差異の有無

CATH_Df

クエリとターゲットのCATH IDの差異の有無

SCOPe_Df

クエリとターゲットのSCOPe IDの差異の有無

ChEMBL_Assay

ChEMBLのAssay情報の有無

AlignedResidues

アミノ酸残基アライメント結果