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PoSSuM
(Drug Search)既知サイト間相同性データ
データ説明
データ名
(Drug Search)既知サイト間相同性データ
DOI
10.18908/lsdba.nbdc01144-009
データ内容の説明
(Drug Search)クエリサイトとターゲットサイトの中で、既知の結合サイト間の相同性を示すデータです。
データファイル
データファイル名:
possum_binding_sites_known_similarity.zip
データのURL:
https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/possum/LATEST/possum_binding_sites_known_similarity.zip
ファイルサイズ:
2.4 MB
簡易検索URL
https://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/possum_binding_sites_known_similarity
データ取得方法
PDB
解析方法
-
データ件数
50,626件
データ詳細
項目名
項目の説明
Q:PocketIndex
クエリサイトの内部ID
T:PocketIndex
ターゲットサイトの内部ID
Q:PDB_ID
クエリサイトのPDB ID
T:PDB_ID
ターゲットサイトのPDB ID
Q:HET_Code
クエリサイトのHETコード
T:HET_Code
ターゲットサイトのHETコード
Q:ChainID
クエリサイトのある鎖のID
T:ChainID
ターゲットサイトのある鎖のID
Q:Res.No.
クエリサイトのアミノ酸残基番号
T:Res.No.
ターゲットサイトのアミノ酸残基番号
AlignedLength
アミノ酸アライメント長
RMSD
平均二乗偏差
AminoIdentity
アミノ酸の一致率
Q:MolName
クエリの分子名
T:MolName
ターゲットの分子名
Q:EC
クエリのEC ID
T:EC
ターゲットのEC ID
Q:CATH
クエリのCATH ID
T:CATH
ターゲットのCATH ID
Q:SCOPe
クエリのSCOPe ID
T:SCOPe
ターゲットのSCOPe ID
Q:UniProt
クエリのUniProt ID
T:UniProt
ターゲットのUniProt ID
Q:UniRef50
クエリのUniRef50クラスタID(解析当時のもの)
T:UniRef50
ターゲットのUniRef50クラスタID(解析当時のもの)
EC_Df
クエリとターゲットのEC IDの差異の有無
CATH_Df
クエリとターゲットのCATH IDの差異の有無
SCOPe_Df
クエリとターゲットのSCOPe IDの差異の有無
ChEMBL_Assay
ChEMBLのAssay情報の有無
AlignedResidues
アミノ酸残基アライメント結果
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