サイト間相同性データ

データ名

サイト間相同性データ

DOI

データ内容の説明

既知と未知の結合サイト間の相同性を示すデータです。

データファイル

データファイル名:

possum_ppair.zip

データのURL:

ファイルサイズ:

5.4 GB

簡易検索URL

データ取得方法

PDB

解析方法

データ件数

81,069,340件

項目名	項目の説明
Q:PocketIndex	クエリサイトの内部ID
Ｔ:PocketIndex	ターゲットサイトの内部ID
Q:PDB_ID	クエリサイトのPDB ID
T:PDB_ID	ターゲットサイトのPDB ID
Q:HET_Code	クエリサイトのHETコード
T:HET_Code	ターゲットサイトのHETコード
Q:ChainID	クエリサイトのある鎖のID
T:ChainID	ターゲットサイトのある鎖のID
Q:Res.No.	クエリサイトのアミノ酸残基番号
T:Res.No.	ターゲットサイトのアミノ酸残基番号
Cosine	物理化学・幾何学的な特性で比較したコサイン類似度
AlignedLength	アミノ酸アライメント長
RMSD	平均二乗偏差
TM-score	タンパク質構造で比較したTemplate modeling score
Pval	類似度のP-Value
AminoIdentity	アミノ酸の一致率
MolName	サイトの分子名
EC	サイトのEC ID
CATH	サイトのCATH ID
SCOPe	サイトのSCOPe ID
UniProt	サイトのUniProt ID
UniRef50	サイトのUniRef50クラスタID（解析当時のもの）
GO1	サイトの分子機能を表すGene Ontology
GO2	サイトの分子機能を表すGene Ontology
GO3	サイトの分子機能を表すGene Ontology
AlignedResidues	アミノ酸残基アライメント結果

このデータベースについて