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このデータベースについて

未知結合サイト

データ説明
データ名
未知結合サイト
DOI
10.18908/lsdba.nbdc01144-002
データ内容の説明
タンパク質上の結合サイトのうち、存在が確認されてはいないが、結合サイトであると推定されたものの情報です。
データファイル
データファイル名 :
possum_psite.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
27 MB
簡易検索URL
-
データ取得方法

PDB

解析方法

-

データ件数

1,203,295件

データ詳細
項目名 項目の説明
PocketIndex

結合サイトの内部ID

PDB_ID

タンパク質のPDB ID

HET_Code

結合するリガンドのHETコード

ChainID

結合サイトのある鎖のID

ResLength

サイトの残基数

Atoms

リガンドの原子数

MolName

サイトの分子名

EC

サイトのEC ID

CATH

サイトのCATH ID

SCOPe

サイトのSCOPe ID

UniProt

サイトのUniProt ID

UniRef50

サイトのUniRef50クラスタID(解析当時のもの)

GO1

サイトの分子機能を表すGene Ontology

GO2

サイトの分子機能を表すGene Ontology

GO3

サイトの分子機能を表すGene Ontology