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生命科学系データベースアーカイブ

PoSSuM

未知結合サイト

データ説明

info データ名 未知結合サイト
info DOI 
info データ内容の説明 

タンパク質上の結合サイトのうち、存在が確認されてはいないが、結合サイトであると推定されたものの情報です。

info データファイル 
データファイル名:
possum_psite.zip
データのURL:
https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/possum/LATEST/possum_psite.zip
ファイルサイズ:
27 MB
info 簡易検索URL -
info データ取得方法 

PDB

info 解析方法 -
info データ件数 

1,203,295件

データ詳細

項目名項目の説明
PocketIndex 結合サイトの内部ID
PDB_ID タンパク質のPDB ID
HET_Code 結合するリガンドのHETコード
ChainID 結合サイトのある鎖のID
ResLength サイトの残基数
Atoms リガンドの原子数
MolName サイトの分子名
EC サイトのEC ID
CATH サイトのCATH ID
SCOPe サイトのSCOPe ID
UniProt サイトのUniProt ID
UniRef50 サイトのUniRef50クラスタID（解析当時のもの）
GO1 サイトの分子機能を表すGene Ontology
GO2 サイトの分子機能を表すGene Ontology
GO3 サイトの分子機能を表すGene Ontology