PGDBj 登録生物種リスト・マーカーリスト・QTLリスト・DBリンク・ゲノム解析手法
このデータベースについて
データベースの説明
| データベース全般 | ||||||||||
名称
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PGDBj 登録生物種リスト・マーカーリスト・QTLリスト・DBリンク・ゲノム解析手法
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名称の読み方
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別名
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PGDBj Marker・Map・基本情報 | |||||||||
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DOI
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10.18908/lsdba.nbdc01194-01-000.V003 |
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バージョン
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作成者
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作成氏名
柴谷多恵子
作成者英名
Taeko Shibaya
作成者所属
かずさDNA研究所
作成者の文献検索
作成氏名
市原寿子 
作成者英名
Hisako Ichihara
作成者所属
大阪大学
作成者の文献検索
作成氏名
白澤沙智子
作成者英名
Sachiko Shirasawa
作成者所属
かずさDNA研究所
作成氏名
浅水恵理香
作成者英名
Erika Asamizu
作成者所属
龍谷大学
作成者の文献検索
作成氏名
中村保一 
作成者英名
Yasukazu Nakamura
作成者所属
かずさDNA研究所
作成者の文献検索
作成氏名
平川英樹
作成者英名
Hideki Hirakawa
作成者所属
かずさDNA研究所
作成者の文献検索
作成氏名
中谷明弘
作成者英名
Akihiro Nakaya
作成者所属
大阪大学
作成者の文献検索
作成氏名
田畑哲之*
作成者英名
Satoshi Tabata
作成者所属
かずさDNA研究所
作成者の文献検索
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連絡先
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公益財団法人かずさDNA研究所 〒２９２ - ０８１８ 千葉県木更津市かずさ鎌足２ - ６ - ７ 
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データベース分類
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植物データベース
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データベースの説明
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DNAマーカーと遺伝地図は、遺伝解析による有用遺伝子の同定やゲノム構造比較の他、マーカー選抜育種やDNA鑑定などの応用研究にも利用されます。本データベースでは、園芸作物を中心とした６５植物種について、DNAマーカー（６５生物種分）と、重要な農業形質に関わるQTLおよび地図情報（４５生物種分）を文献や外部データベースから収集・整理し、公開しました。また、８０植物種について、基本情報、ゲノム解析手法、関連ウェブサイトのリンク情報を収集・整理し、公開しました。 |
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データベースの特長・有用性・活用方法
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本データベースでは、病害抵抗性、環境ストレス耐性、収量などの形質に着目した情報整備を行っています。このため、これらをキーワードとしたDNAマーカーやQTLの検索が可能です。また、DNAマーカーを用いたタイピングの実験条件に関する情報収集と整備も行っており、利用者が有する材料で実験する際の条件検索も可能です。 |
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データベースの利用許諾
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CC 表示-継承 詳細 | |||||||||
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予算的背景・プロジェクト
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名称
ライフサイエンスデータベース統合推進事業 統合化推進プログラム「ゲノム情報に基づく植物データベースの統合」 H23-H25年度 
名称
ライフサイエンスデータベース統合推進事業 統合化推進プログラム「植物ゲノム情報活用のための統合研究基盤の構築」H26-H28年度 |
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論文等
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文献名
Plant Genome DataBase Japan (PGDBj): A Portal Website for the Integration of Plant Genome-Related Databases
著者名
Erika Asamizu, Hisako Ichihara, Akihiro Nakaya, Yasukazu Nakamura, Hideki Hirakawa, Takahiro Ishii, Takuro Tamura, Kaoru Fukami-Kobayashi, Yukari Nakajima and Satoshi Tabata
雑誌名/掲載年月/号
Plant Cell Physiol (2014) 55 (1): e8
外部リンク
文献名
Plant Genome DataBase Japan (PGDBj)
著者名
Akihiro Nakaya, Hisako Ichihara, Erika Asamizu, Shirasawa Sachiko, Yasukazu Nakamura, Satoshi Tabata and Hideki Hirakawa
雑誌名/掲載年月/号
Methods Mol Biol (2017) 1533: 45-77.
外部リンク
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| データベースのオリジナルサイト情報 | ||||||||||
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データベース運用場所
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オリジナルサイト
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http://pgdbj.jp/pages/index.html?dir=&page=mk&ln=ja | |||||||||
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運用開始年月日
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2012年8月8日 | |||||||||
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最終更新年月日
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2017年3月31日 | |||||||||
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統括サイト
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http://pgdbj.jp/index.html?ln=ja | |||||||||
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データの一括ダウンロードサイト
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参照先データベース
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一覧表示
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有り | |||||||||
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クエリ検索
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有り | |||||||||
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Webサービス
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無し | |||||||||
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WebサービスURL
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