データベース全般 | ||||||||||
 名称 | PGDBj 登録生物種リスト・マーカーリスト・QTLリスト・DBリンク・ゲノム解析手法 | |||||||||
| 名称の読み方 | - | |||||||||
| 別名 | PGDBj Marker・Map・基本情報 | |||||||||
| DOI | 10.18908/lsdba.nbdc01194-01-000.V003 | |||||||||
| バージョン |
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| 作成者 | ||||||||||
| 連絡先 | 公益財団法人かずさDNA研究所 | |||||||||
| データベース分類 | 植物データベース 塩基配列データベース ゲノミクスデータベース (脊椎動物以外) データベースカタログ | |||||||||
| 生物種 | ゲノム解読とDNAマーカー開発が進んでいる８０植物種を対象としています。特にDNAマーカーやQTL情報の整備については、園芸作物を中心とした６５植物種を対象としています。 | |||||||||
| データベースの説明 | DNAマーカーと遺伝地図は、遺伝解析による有用遺伝子の同定やゲノム構造比較の他、マーカー選抜育種やDNA鑑定などの応用研究にも利用されます。本データベースでは、園芸作物を中心とした６５植物種について、DNAマーカー（６５生物種分）と、重要な農業形質に関わるQTLおよび地図情報（４５生物種分）を文献や外部データベースから収集・整理し、公開しました。また、８０植物種について、基本情報、ゲノム解析手法、関連ウェブサイトのリンク情報を収集・整理し、公開しました。 | |||||||||
| データベースの特長・有用性・活用方法 | 本データベースでは、病害抵抗性、環境ストレス耐性、収量などの形質に着目した情報整備を行っています。このため、これらをキーワードとしたDNAマーカーやQTLの検索が可能です。また、DNAマーカーを用いたタイピングの実験条件に関する情報収集と整備も行っており、利用者が有する材料で実験する際の条件検索も可能です。 | |||||||||
| データベースの利用許諾 | - | |||||||||
| 予算的背景・プロジェクト | ||||||||||
| 論文等 | ||||||||||
データベースのオリジナルサイト情報 | ||||||||||
| データベース運用場所 | ||||||||||
| オリジナルサイト | http://pgdbj.jp/pages/index.html?dir=&page=mk&ln=ja | |||||||||
| 運用開始年月日 | 2012年8月8日 | |||||||||
| 最終更新年月日 | 2017年3月31日 | |||||||||
| 統括サイト | http://pgdbj.jp/index.html?ln=ja | |||||||||
| データの一括ダウンロードサイト | - | |||||||||
| 参照先データベース | - | |||||||||
| 一覧表示 | 有り | |||||||||
| クエリ検索 | 有り | |||||||||
| Webサービス | 無し | |||||||||
| WebサービスURL | - | |||||||||
| ユーザ登録 | 無し | |||||||||
