データベース全般 | |
PCDq![]() | |
| ピー・シー・ディー・キュー | |
| Protein Complex Database with complex quality index | |
| 10.18908/lsdba.nbdc01200-000 | |
(独)産業技術総合研究所
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| タンパク質複合体データベース | |
PCDq は、予測複合体を含めたヒト蛋白質複合体のデータベースです。 | |
BIND、DIP、MINT、HPRD、IntActおよびGNP_Y2Hの6つの蛋白質間相互作用(PPI)データを整理統合し、PPIネットワークの密な領域から蛋白質複合体が予測され、それらを文献と比較し修正することで、既知の複合体情報と予測された複合体情報の両方を格納しています。既知と予測のサブユニットを区別・活用するため、品質管理指数(complex quality index: CQI)を、各複合体に付与しています。また、複雑なネットワークを簡素に示す図を表示・編集できる機能PPI-Mapがあります。 *慣行に従い、PCDqを研究等で利用する場合は、「論文等」に記載されている論文を引用してください。
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| CC 表示-継承 詳細 | |
データベースのオリジナルサイト情報 | |
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター | |
| http://h-invitational.jp/hinv/pcdq/ | |
| 2012/08/03 | |
| 2012/07/23 | |
| http://h-invitational.jp/hinv/ahg-db/index_ja.jsp | |
| http://h-invitational.jp/hinv/dataset/download.cgi | |
HIP | HIT | HIX | UniProt | RefSeq | GeneID | CCDS | BIND | DIP | MINT | HPRD | IntAct | GNP_Y2H | PubMed | |
| 有り | |
| 有り | |
| 無し | |
| - | |
| 無し | |