データベース全般 | |
 名称 | OpenPML |
| 名称の読み方 | オープンピーエムエル |
| 別名 | - |
| DOI | 10.18908/lsdba.nbdc01204-000 |
| 作成者 | |
| 連絡先 | 一般社団法人バイオ産業情報化コンソーシアム (JBIC) |
| データベース分類 | その他の分子生物学データベース |
| データベース分類 | データ記述形式 |
| データベースの説明 | 遺伝型－表現型データ記述形式の標準化規格PML について記述したものです。あわせてPaGE-OMの説明、スキーマやサンプルスクリプトなどを公開しています。ゲノムの多様性と表現型の多様性の関係についての研究には、大規模且つ多様なデータを多くの協力者や研究者の間で共有することが不可欠です。そのためには各々の研究者がデータの互換性を担保した統一のとれた方法でデータを記述することが重要となります。 PaGE-OM (Phenotype and Genotype-Object Model)とはデータ記述のためのデータモデルです。 |
| データベースの特長・有用性・活用方法 | 遺伝型－表現型データベースを作成するときに、国際標準規格に基づいた形式で記述することができます。ゲノム多型と表現型のデータベースを開発する際に、国際標準形式で作成することができます。また、PMLで作成されたデータは再利用しやすいことになります。 |
| データベースの利用許諾 | CC 表示-継承 詳細 |
| 予算的背景・プロジェクト | 世界中の遺伝型－表現型データベースを統合利用できるように、データ記述形式の標準化を行うため、新エネルギー・産業技術総合開発機構（NEDO）予算のプロジェクト「遺伝型－表現型データベースのデータ記述形式標準化事業」が2005年度から2008年度まで行われました。予算は平成17年度から平成20年度で、総額約17億円。PMLはその１つの成果です。 |
| 予算的背景・プロジェクト | |
| 論文等 | |
データベースのオリジナルサイト情報 | |
| データベース運用場所 | 運用停止しました。なおアーカイブ版はhttp://dbarchive.biosciencedbc.jp/archive/openpml/で閲覧可能です。 |
| オリジナルサイト | - |
| 運用開始年月日 | - |
| 最終更新年月日 | 2010/08/10 |
| 統括サイト | - |
| データの一括ダウンロードサイト | - |
| 参照先データベース | - |
| 一覧表示 | 無し |
| クエリ検索 | 無し |
| Webサービス | 無し |
| WebサービスURL | - |
| ユーザ登録 | 無し |
