項目名 | 項目の説明 |
BARCODE |
使用したGeneChipを識別するためのバーコードです。CELファイル名の拡張子を除いた部分はこのBARCODEと一致します。 |
ARR_DESIGN |
GeneChipのデザイン名です。トキシコゲノミクスプロジェクトではHumanのチップはHG-U133_Plus_2、RatのチップはRat230_2を用いています。 |
EXP_ID |
実験セット毎に付けられたIDです。in vivo試験は0040~となっています。in vitro試験は5000番以降が付与されています。主にCOMPOUND_NAME、SPECIES、 EXP_TEST_TYPE、SINGLE_REPEAT_TYPEの組み合わせで定まります。 |
GROUP_ID |
群毎に付けられたIDです。01~16など二桁の数字が割り当てられています。主にDOSE_LEVEL、SACRIFICE_PERIODの組み合わせで定まります。 |
INDIVIDUAL_ID |
同一群内で、in vivo試験における個体、in vitro試験における試料に付けられたIDです。1から一桁の数字が割り当てられています。 |
ORGAN |
臓器の種類を表しています。LiverとKidneyの2種類が存在します。 |
MATERIAL_ID |
遺伝子発現データの取得に用いたサンプル切片を識別するためのIDです。Aから始まりB、Cという記号が付与されています。 |
COMPOUND_NAME |
化合物の名称です。 |
COMPOUND_ABBREVIATION |
化合物の略称です。 |
COMPOUND_NO |
化合物識別のために割り振った番号です。通し番号となっておらず欠番も存在します。 |
SPECIES |
生物種を表しています。 |
EXP_TEST_TYPE |
実験系(in vivo試験、in vitro試験)を表しています。 |
SINGLE_REPEAT_TYPE |
in vivo試験における投与回数(単回投与:Single、28日間反復投与:Repeat)を表しています。 |
SEX_TYPE |
性別を表しています。 |
STRAIN_TYPE |
in vivo試験におけるラットの系統を表しています。 |
ADMINISTRATION_ROUTE_TYPE |
化合物の投与経路を表しています。 |
ANIMAL_AGE(week) |
in vivo試験におけるラットの週齢を表しています。6週齢データのみが存在します。 |
SACRIFICE_PERIOD |
in vivo試験における屠殺時間、in vitro試験における曝露時間を表しています。 |
DOSE |
投与量を表しています。 |
DOSE_UNIT |
投与量の単位を表しています。 |
DOSE_LEVEL |
投与量のレベルを表しています。投与量の少ない順にControl、Low、Middle、Highとなっています。 |