このデータベースについて
日化辞と他のDBのリンク情報のRDFデータ（UniChem由来）
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データ名
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日化辞と他のDBのリンク情報のRDFデータ（UniChem由来） | ||
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DOI
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10.18908/lsdba.nbdc01530-02-006.V011 |
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データ内容の説明
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InChIKeyの情報に基づき化合物データベース間の化合物IDのマッピング情報を提供しているUniChem(<a href="https://www.ebi.ac.uk/unichem/">https://www.ebi.ac.uk/unichem/</a>)のデータを活用し、日化辞化合物と他のデータベース*で収録されている化合物との対応関係をskos:closeMatchを用いて記述したRDFデータ。 *: ChEMBL, DrugBank, PDB, Guide to Pharmacology, KEGG, ChEBI, ZINC, Gene Expression Atlas, PharmGKB, Human Metabolome Database (HMDB), PubChem, NMRShiftDB, Aggregated Computational Toxicology Resource (ACToR), BindingDB, KNApSAcK. | ||
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データファイル
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データファイル名 :
NBDC_NikkajiRDF_link2OtherDBs_basedOnUniChem.tar.gz
データのURL :
ファイルサイズ :
69 MB
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簡易検索URL
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データ取得方法
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このデータはUniChemのFTPサイト（ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/chembl/UniChem/）でダウンロードした日化辞化合物と他の化合物データベースの化合物のマッピングデータから作成。KNApSAcK (http://kanaya.naist.jp/KNApSAcK/)のマッピングデータは、KNApSAcKが提供するInChIKeyから生成。 |
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解析方法
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データ件数
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18,910,927 トリプル |
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| データ詳細 | |||
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