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このデータベースについて

Refsequence

データ説明
データ名
Refsequence
DOI
10.18908/lsdba.nbdc01181-005.V002
バージョン
V2 10.18908/lsdba.nbdc01181-005.V002 更新履歴
V1 10.18908/lsdba.nbdc01181-005.V001 -
データ内容の説明
微生物の高精度ドラフトまたは完全ゲノム(RefSeq/GenBank)のアノテーション情報をRDF化したデータです。対応するアミノ酸配列データは、MicrobeDB.jp version 2において、MBGDのオーソログクラスタリングや、メタゲノム中の遺伝子の機能推定等に用いております。 データファイル(tar.gzip圧縮)はゲノムごとのディレクトリに分かれており、repliconごとのゲノムRDFファイルが存在します。
データファイル
データファイル名 :
refsequence.tar.gz
データのURL :
ファイルサイズ :
49 GB
簡易検索URL
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データ取得方法

微生物の、完全ゲノムおよび、MBGDの基準によって高精度と判定されたドラフトゲノムのアノテーション情報について、RefSeq/GenBankのGenBank形式ファイルをNCBIサイトからダウンロードしRDFに変換しました。

解析方法

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データ件数

4,165,436,499 トリプル

データ詳細
データ詳細はありません。
項目名 項目の説明