InterProScan検索結果

データ名

InterProScan検索結果

DOI

データ内容の説明

クラスタの代表的ESTに対して、InterProScanを行った結果の一覧です。

データファイル

データファイル名:

kaiko_cdna_interpro.zip

データのURL:

ファイルサイズ:

3.1 MB

簡易検索URL

データ取得方法

「ORF情報」データ

解析方法

クラスタの代表的ESTのORFに対して、InterProで検索した結果による注釈（アノテーション）を付けています。

データ件数

112,731 件

項目名	項目の説明
Rep ID	代表的ESTのアクセション番号
ORF Name	ORFの名前
CRC64	各配列におけるCRC64の値
Length	配列の長さ (bp)
Analysis	解析プログラム
Signature Accession	モチーフのaccession
Signature Description	モチーフのdescription
Start location	モチーフの開始位置
Stop location	モチーフの終了位置
Score	機能部位配列への一致度のE-value
Status	機能部位配列との一致状況のステータス (“T”=一致)
InterPro accession	InterProアノテーションのaccession
InterPro description	InterProアノテーションのdescription
GO terms	GOターム

このデータベースについて