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このデータベースについて

遺伝子情報

データ説明
データ名
遺伝子情報
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00077-002
データ内容の説明
大腸菌<em>Escherichia coli</em>のORF及び遺伝子の情報
データファイル
データファイル名 :
genobase_gene.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
334KB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/genobase_v6_gene
データ取得方法

-

解析方法

-

データ件数

5,626件

データ詳細
項目名 項目の説明
Gene ID

遺伝子のID

Key

配列の種類("orf", "rna","rep_origin"のいずれか)

Gene Name

遺伝子の名前

Synonym

遺伝子名のシノニム

Left Point

ORFのゲノム上の開始位置

Right Point

ORFのゲノム上の終了位置

Direction

ORFの向き(5'->3'なら1、3'->5'なら-1、不明なら0)

Function

遺伝子の機能(現在は利用されていない)

Description

遺伝子の説明

Comment

この遺伝子に対するコメント

Reference

この遺伝子について記載された文献

Old JW

以前のバージョンのGenoBaseにおけるGene ID

Sharp ID

遺伝子のID(Gene IDとは別の体系)

Old ID

以前に割り当てられていたSharp ID

MG1655 ID

この遺伝子情報を得るためにシーケンスされたMG1655クローンのID

Swissprot

この遺伝子に関連するSwissprotのID(現在は利用されていない)

E value

この遺伝子配列と他の配列との間の相同性の期待値

EC ID

この遺伝子に関連する酵素番号

EG ID

この遺伝子に関連するEcoGeneのID

PEC ID

この遺伝子に関連するProfiling of E.coli ChoromosomeのID

New JW

現在のバージョンのGenoBaseにおけるGene ID(現在使用されていないエントリに付与されている)

Accession

遺伝子に関連するUniprotエントリのID

ECK No

このエントリに対応するEscherichia coli K-12株上の遺伝子番号、ECK-COG情報にリンク

Locus

遺伝子座の名前

History

このエントリの変更履歴

Comment2

この遺伝子に対するコメント

Literature

この遺伝子に関する文献のPubmed ID

Status

このエントリの状態(最新であれば"current"、古いものであればどのバージョンで変更されたかが記載されている)