項目名 | 項目の説明 |
Accession Number (アクセッション番号) |
Soil Icon |
土壌群と土地利用を記号で表示
|
Accession Number (アクセッション番号) |
管理者が指定する土壌登録番号
*Accession Numberの識別
・ハイフン前方の6桁の数字が同じ場合、同一反復(処理)区かつ同一採取日のサンプルであることを示す ・ハイフン後方について 例)001531-1, 001531-2・・・ 1処理区の2反復 001533-0 ・・・ 反復のない場合 001534-a, 001534-b ・・・ 1処理区内の2サブサンプル 001536-1a, 001536-1b ・・・ 1反復内の2サブサンプル 001538-1* ・・・ *はその反復(処理区)を代表するサンプルであることを示す 001539-1.1, 001539-1.2 ・・・ドットの後の数字は、1反復(処理区)の土からDNA抽出を複数回 行った場合の識別 001541-1.mix ・・・ ドットの後の「mix」表示は、同じ土からとった複数のDNA抽出サンプルを 混合した場合の識別 001542-1.repeat ・・・ ドットの後の「repeat」表示は、既に同一サンプルを登録してある場合の識別
|
Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE) |
DNA Marker Information (対象マーカー情報) |
marker for bacterium, fungas, nematodeから選択 |
Lane Number (レーン番号) |
DGGEゲル画像におけるレーン番号(左側から) |
Quality (精度) |
精度 |
DGGE Gel Image |
DGGEゲル画像 |
Associated Data (関連データ) |
Repeat Data (反復データ) |
反復データがある場合に表示 |
Microorganisms (微生物) |
他の微生物を対象としたデータがある場合に表示 |
Diversity Index (多様性指数) |
Richness (R) (種の豊富さ) |
種の豊富さ |
Shannon index (H’) (シャノン指数) |
シャノン指数 |
Simpson index (1-D) (シンプソン指数) |
シンプソン指数 |
Sample Registration (サンプル登録) |
Collector (採取者名) |
採取者名 |
Affiliation (所属名) |
所属名 |
Sampling Date (採取年月日) |
採取年月日 |
Experimental Purpose (試験目的) |
Experimental Purpose (試験目的) |
例)肥料と収量の関係 |
Experimental Plan (試験設計) |
Experimental Plan (試験設計) |
例)X区=A処理×B処理×C反復、あるいは現地調査A地点の反復サンプルCなどのように
|
Sample Information (サンプル情報) |
Sample Information (サンプル情報) |
DNA情報に相当するサンプルの情報 例)X処理のZ区の反復2番目 |
Experimental Plot (試験区面積) |
Experimental Plot (試験区面積) |
試験区面積 |
Sampling Site (採取場所) |
Latitude (緯度(北緯)) * 非公開にしました(2019/10/17) |
緯度(北緯) |
Longitude (経度(東経)) * 非公開にしました(2019/10/17) |
経度(東経) |
Location * 非公開にしました(2019/10/17) |
サンプルの採取場所を示すGoogle Mapsへのリンク |
Note (備考) |
備考 |
Origin (由来) |
Origin (由来) |
non-rhizosphere(非根圏)、rhizosphere(根圏)、その他から選択 |
Note (備考) |
備考 |
Soil Groups (土壌群) |
Soil Groups (土壌群) |
農耕地土壌分類(第3次案)の24群から選択 |
Land Use (土地利用) |
Land Use (土地利用) |
田、普通畑、樹園地(果樹園・茶園)、草地(牧草地・放牧地等)、その他(耕作放棄地・非農耕地)から選択 |
Physical and Chemical Properties of Soil (土壌物理化学性) |
Soil Texture (土性) |
土性11項目から選択 |
pH (pH (風乾土)) |
pH (風乾土) |
EC (EC) |
EC |
Total C (炭素含有率) |
炭素含有率 |
Total N (窒素含有率) |
窒素含有率 |
Soil Biomass (土壌バイオマス) |
微生物バイオマス量 |
Available P (可給態P) |
トルオーグリン酸 |
Nitrogen Mineralization Rate (窒素無機化量) |
培養法(土壌標準分析測定法に準ずる) |
Soil Respiration Activity (土壌呼吸活性) |
土壌呼吸活性 |
Soil Moisture Content (土壌水分(生土あたりの含水量)) |
土壌水分(生土あたりの含水量) |
Cation Exchange Capacity (CEC) (陽イオン交換容量) |
陽イオン交換容量 |
The Others (その他) |
その他 |
Crop (栽培作物) |
Crop (作物名) |
作物名 |
Cultivar (品種) |
品種 |
Planting Density (1) (栽植密度) |
密度(本/m2) |
Planting Density (2) (栽培様式) |
畝間 or 条間(cm)×株間(cm) |
Note (備考) |
備考 |
Organic Fertilizer (有機質肥料) |
Kind of Organic Material (有機物の種類) |
有機物の種類 |
Rate of Application (施用量) |
施用量 |
Year of Continuous Application (連用年数) |
連用年数 |
Time of Fertilizer Application (施用時期) |
春、夏、秋、冬から選択 |
Chemical Fertilizer (化学肥料) |
Kind of Fertilizer (肥料の種類) |
肥料の種類 |
Rate of Fertilizer Application (施用量) |
施用量 |
Year of Continuous Application (連用年数) |
連用年数 |
Time of Fertilizer Application (施用時期) |
春、夏、秋、冬から選択 |
Pesticide Application (薬剤散布) |
Kind of Pesticide (薬剤の種類) |
薬剤の種類 |
Rate of Pesticide Application (施用量) |
施用量 |
Year of Continuous Application (連用年数) |
連用年数 |
Time of Pesticide Application (施用時期) |
春、夏、秋、冬から選択 |
Water Management (水管理) |
Water Management (水管理) |
水管理 |
Experimental Result (試験結果) |
Experimental Result (試験結果) |
調査データ(収量、病害発生等) |
Cultivation History (栽培暦) |
Former Cultivated Crop (前作物名) |
前作物名 |
Seeding or Transplanting Date (作業日) |
播種日または移植日(裸地などの場合はNDと記入) |
Harvest Date (収穫日) |
収穫日 |
Temperature (気温) |
Temperature (気温) |
気温 |
DNA Sequence (DNA) |
DNA Extraction Methods (抽出法) |
スタンダード法か、独自法か選択 |
Sample Name (サンプル名) |
サンプル名 |
Target DNA (種類) |
例)16S rDNA |
Note (備考) |
備考 |
Other Related Date (その他関連データ) |
Gradient of Denaturing Agent (変性剤濃度勾配) |
変性剤濃度勾配 |
Run Voltage (泳動電圧) |
泳動電圧 |
Run Time (泳動時間) |
泳動時間 |
Run Temperature (泳動温度) |
泳動温度 |
Amount of Sample DNA (泳動DNA量) |
泳動DNA量 |
Note (備考) |
備考 |
Download |
DGGE Gel Image |
DGGEゲル画像 |
Environmental Data |
環境データ |
All Data |
全データ |