DoBISCUIT HTMLコンテンツ

データ名

DoBISCUIT HTMLコンテンツ

DOI

データ内容の説明

データベース化されていたDoBISCUITのコンテンツをStatic HTMLに変換したもの。利用者は、データベースシステムやWebサーバを使うことなく手元のPC等でコンテンツを参照することができる。Google Chromeで動作確認している。

データファイル

データファイル名:

dobiscuit_arc.zip

データのURL:

ファイルサイズ:

104 MB

簡易検索URL

データ取得方法

NCBI, Uniprot, Interpro

解析方法

クラスターや遺伝子に関する論文情報を元にマニュアルで位置関係を設定している。

データ件数

cluster/cds: 108

**Cluster**
項目名	項目の説明
Compound	二次代謝産物の化合物としての特徴
Original source	遺伝子クラスターの塩基配列ソース
PKS/NRPS Module	遺伝子クラスターに含まれるPKS/NRPSのモジュールとそのドメイン構成と文献で確認されている基質
Reference	関連文献
Data download	DoBISCUITの登録情報についてのダウンロードファイル
History	更新履歴

**CDS**
項目名	項目の説明
Location	遺伝子クラスター内のCDSの位置と向き、長さ等
Annotation	遺伝子クラスター内のCDSの機能についてのアノテーションと文献からの根拠情報
Feature	遺伝子クラスター内のCDSのドメイン構造
Sequence	遺伝子クラスター内のCDSの塩基配列とアミノ酸配列

このデータベースについて