データ説明 |
データ名 | Refgene_exonデータ |
DOI | 10.18908/lsdba.nbdc01077-007 |
データ内容の説明 | H-Invitational transcript ID (HIT) に関するアノテーション情報 ただし、chrが「_random」を含むエントリは、各座標に関して注意が必要である。 UCSCの「_random」を含むゲノム配列の構成は、染色体中の位置が未確定のセグメントを 50,000bpのスペーサーで挟んで1本に繋いだものとなっている ( http://genome.ucsc.edu/FAQ/FAQdownloads.html#download9, http://genome.ucsc.edu/FAQ/FAQdownloads.html#download10 )。 このゲノム配列にHIT転写物がマッピングされているので、以下の座標表記となっている。 a_*:各セグメント上の座標を示す。セグメントの区別は記載なし。 cds_*、e_*:セグメントを50,000bpのスペーサーを挟みつつ1本に繋いだ上での座標。 なお同一転写物のexonが異なるセグメントにマッピングされているケースもある。 |
データファイル |
|
簡易検索URL | http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/dnaprobelocator_refgene_exon |
データ取得方法 | H-Invitational DBから取得 |
解析方法 | - |
データ件数 | 167,564件 |
データ詳細 |
|