データベース全般 | |
 名称 | DB-SPIRE |
| 名称の読み方 | デービースパイア |
| 別名 | - |
| DOI | 10.18908/lsdba.nbdc00411-000 |
| 作成者 | |
| 連絡先 | 野口 保 |
| データベース分類 | 構造データベース-タンパク質構造 |
| データベースの説明 | 本データベースは、実験的または配列解析（ホモロジーサーチとマルチプルアライメント）によって同定されたアミノ酸配列モチーフのタンパク質立体構造における位置を登録したものです。アミノ酸配列モチーフデータベースとして、PROSITEとBLOCKSの2種類を用いました。前者は実験的のみ、後者は実験的および配列解析によるモチーフを登録したデータベースです。タンパク質立体構造データベースとしてはPDBを用い、各エントリーにおけるSEQRES行とATOM 行の両方の配列情報から、それぞれモチーフ位置を決めています。PDBのエントリーによっては、配列情報が一致するとは限らないので、どちらか一方だとモチーフ情報を見落とす可能性があるためです。 |
| データベースの特長・有用性・活用方法 | 本データベースは,バイオインフォマティクスや生化学・構造生物学の実験研究者が,タンパク質立体構造における機能構造を迅速に把握することを可能にすることを目的にしています。 |
| データベースの利用許諾 | CC 表示-継承 詳細 |
| 予算的背景・プロジェクト | - |
| 論文等 | |
データベースのオリジナルサイト情報 | |
| データベース運用場所 | 産業技術総合研究所 臨海副都心センター |
| オリジナルサイト | （運用終了） http://mbs.cbrc.jp/DB-SPIRE |
| 運用開始年月日 | 2005/4/1 |
| 最終更新年月日 | - |
| 統括サイト | - |
| データの一括ダウンロードサイト | - |
| 参照先データベース | PROSITE, BLOCKS, PDB |
| 一覧表示 | - |
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