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ASTRA
このデータベースについて

データベースの説明

データベース全般
名称
ASTRA
名称の読み方
アストラ
別名
Alternative Splicing and Transcription Archives (ASTRA)
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00371-000
作成者
作成氏名
長崎 英樹*
作成者英名
Hideki Nagasaki
作成者所属
産業技術総合研究所 (現在: かずさDNA研究所)
作成者の文献検索
作成氏名
後藤 修
作成者英名
Osamu Gotoh
作成者所属
産業技術総合研究所
作成者の文献検索
作成氏名
有田 正規
作成者英名
Masanori Arita
作成者所属
産業技術総合研究所 (現在: 国立遺伝学研究所)
作成者の文献検索
連絡先
astra address
データベース分類

塩基配列データベース-遺伝子構造、イントロン/エクソン、スプライス部位

生物種
Taxonomy Name
Homo sapiens
Taxonomy ID
Taxonomy Name
Mus musculus
Taxonomy ID
Taxonomy Name
Drosophila melanogaster
Taxonomy ID
Taxonomy Name
Caenorhabditis elegans
Taxonomy ID
Taxonomy Name
Arabidopsis thaliana
Taxonomy ID
Taxonomy Name
Oryza sativa
Taxonomy ID
データベースの説明

6真核生物種のゲノム中の選択的スプライシングと選択的転写開始のパターンデータベース

データベースの特長・有用性・活用方法

ゲノム配列への完全長cDNAのマッピング結果より選択的スプライシングと選択的転写開始によって構造変化を起こしている遺伝子を検索、そのパターンを表示し、アミノ酸配列を出力する。

データベースの利用許諾
CC 表示-継承 詳細
予算的背景・プロジェクト
-
論文等
文献名
Species-specific variation of alternative splicing and transcriptional initiation in six eukaryotes.
著者名
Nagasaki H, Arita M, Nishizawa T, Suwa M, Gotoh O.
雑誌名/掲載年月/号
Gene. 2005 Dec 30;364:53-62.
外部リンク
文献名
Automated classification of alternative splicing and transcriptional initiation and construction of visual database of classified patterns.
著者名
Nagasaki H, Arita M, Nishizawa T, Suwa M, Gotoh O.
雑誌名/掲載年月/号
Bioinformatics. 2006 May 15;22(10):1211-6.
外部リンク
データベースのオリジナルサイト情報
データベース運用場所

産業技術総合研究所

オリジナルサイト
運用終了
運用開始年月日
2005
最終更新年月日
2006
統括サイト
-
データの一括ダウンロードサイト
-
参照先データベース
-
一覧表示
有り
クエリ検索
有り
Webサービス
無し
WebサービスURL
-
ユーザ登録
無し