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生命科学系データベースアーカイブ

ASTRA

データベースの説明

データベース全般

info 名称 ASTRA
info 名称の読み方 アストラ
info 別名 Alternative Splicing and Transcription Archives (ASTRA)
info DOI 
info 作成者 
作成者氏名:
長崎 英樹*
作成者英名:
Hideki Nagasaki
作成者所属:
産業技術総合研究所 (現在: かずさDNA研究所)
作成者の文献検索:
作成者氏名:
後藤 修
作成者英名:
Osamu Gotoh
作成者所属:
産業技術総合研究所
作成者の文献検索:
作成者氏名:
有田 正規
作成者英名:
Masanori Arita
作成者所属:
産業技術総合研究所 (現在: 国立遺伝学研究所)
作成者の文献検索:
info 連絡先 

astra address

info データベース分類 塩基配列データベース-遺伝子構造、イントロン/エクソン、スプライス部位
info 生物種 
生物種名:
Homo sapiens
Taxonomy ID:
生物種名:
Mus musculus
Taxonomy ID:
生物種名:
Drosophila melanogaster
Taxonomy ID:
生物種名:
Caenorhabditis elegans
Taxonomy ID:
生物種名:
Arabidopsis thaliana
Taxonomy ID:
生物種名:
Oryza sativa
Taxonomy ID:
info データベースの説明 

6真核生物種のゲノム中の選択的スプライシングと選択的転写開始のパターンデータベース

info データベースの特長・有用性・活用方法 

ゲノム配列への完全長cDNAのマッピング結果より選択的スプライシングと選択的転写開始によって構造変化を起こしている遺伝子を検索、そのパターンを表示し、アミノ酸配列を出力する。

info データベースの利用許諾 CC 表示-継承 詳細
info 予算的背景・プロジェクト -
info 論文等 
文献名:
Species-specific variation of alternative splicing and transcriptional initiation in six eukaryotes.
著者名:
Nagasaki H, Arita M, Nishizawa T, Suwa M, Gotoh O.
雑誌名/掲載年月/号:
Gene. 2005 Dec 30;364:53-62.
外部リンク:
 
文献名:
Automated classification of alternative splicing and transcriptional initiation and construction of visual database of classified patterns.
著者名:
Nagasaki H, Arita M, Nishizawa T, Suwa M, Gotoh O.
雑誌名/掲載年月/号:
Bioinformatics. 2006 May 15;22(10):1211-6.
外部リンク:
 

データベースのオリジナルサイト情報

info データベース運用場所 

産業技術総合研究所

info オリジナルサイト 運用終了
info 運用開始年月日 2005
info 最終更新年月日 2006
info 統括サイト -
info データの一括ダウンロードサイト -
info 参照先データベース -
info 一覧表示 有り
info クエリ検索 有り
info Webサービス 無し
info WebサービスURL -
info ユーザ登録 無し