cDNA
| データ説明 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
データ名
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cDNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DOI
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10.18908/lsdba.nbdc00371-002 |
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データ内容の説明
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遺伝子座に含まれるcDNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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データファイル
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データファイル名 :
astra_cdna.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
3.3 MB
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簡易検索URL
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http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/astra_cdna | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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データ取得方法
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イネの完全長32k cDNAクローンセットとコーディング領域の配列は、農業生物資源研究所 分子遺伝部 遺伝子発現研究室(Kikuchi et al., 2003; ftp://cdna01.dna.affrc.go.jp/pub/data/CURRENT)から取得した。それ以外の生物種の完全長cDNAは、UniGeneから、コーディング領域と推定される配列をアノテーションに基づいて抽出した。
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解析方法
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完全長cDNA-ゲノム配列のMEGABLASTマッピング後、エキソン-イントロン構造を1と0にビット変換してスプライシングパターンを検出、タイプ分類。遺伝子名はcDNAのアノテーションを元に特定。 |
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データ件数
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84,438 件 |
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| データ詳細 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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