ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for RELA

Query protein: RELA
Cell class: Blood
Sort key: RELA | STRING
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs RELA's Colocalization partners

◢ RELA: Average

◢ SRX4401061: BJAB

◢ SRX4401062: BJAB

◢ SRX4401063: BJAB

◢ SRX4401064: BJAB

◢ SRX4401065: BJAB

◢ SRX4401066: BJAB

◢ SRX5371742: CD4+ T cells

◢ SRX5371743: CD4+ T cells

◢ SRX017887: GM10847

◢ SRX017888: GM10847

◢ SRX017889: GM10847

◢ SRX017890: GM10847

◢ SRX017891: GM10847

◢ SRX150606: GM10847

◢ SRX017905: GM12878

◢ SRX017906: GM12878

◢ SRX017907: GM12878

◢ SRX017908: GM12878

◢ SRX150557: GM12878

◢ SRX2837382: GM12878

◢ SRX017911: GM12891

◢ SRX017912: GM12891

◢ SRX017913: GM12891

◢ SRX150605: GM12891

◢ SRX017882: GM12892

◢ SRX017883: GM12892

◢ SRX017884: GM12892

◢ SRX150365: GM12892

◢ SRX017875: GM15510

◢ SRX017876: GM15510

◢ SRX017877: GM15510

◢ SRX017878: GM15510

◢ SRX017879: GM15510

◢ SRX150608: GM15510

◢ SRX017863: GM18526

◢ SRX017864: GM18526

◢ SRX017865: GM18526

◢ SRX017866: GM18526

◢ SRX017867: GM18526

◢ SRX017900: GM18526

◢ SRX017901: GM18526

◢ SRX017902: GM18526

◢ SRX150361: GM18526

◢ SRX150362: GM18526

◢ SRX017894: GM18951

◢ SRX017895: GM18951

◢ SRX017896: GM18951

◢ SRX017897: GM18951

◢ SRX150610: GM18951

◢ SRX017870: GM19099

◢ SRX017871: GM19099

◢ SRX017872: GM19099

◢ SRX150353: GM19099

◢ SRX017858: GM19193

◢ SRX017859: GM19193

◢ SRX017860: GM19193

◢ SRX150359: GM19193

◢ SRX790965: L-1236

◢ SRX790966: L-1236

◢ SRX256997: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX256998: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX256999: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX257000: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX7083406: RAMOS

◢ SRX1460847: Th1 Cells

◢ SRX1460848: Th1 Cells

◢ SRX4001966: THP-1

◢ SRX4001967: THP-1

◣ RELA: STRING

GM12878
 SRX475754
EP300
GM12878
 SRX475753
EP300
GM12878
 SRX392820
EP300
GM12878
 SRX392819
EP300
GM12878
 SRX475748
EP300
GM12878
 SRX475751
EP300
GM12878
 SRX475750
EP300
GM12878
 SRX475749
EP300
GM12878
 SRX150374
EP300
GM12878
 SRX475752
EP300
GM12878
 SRX150641
EP300
GM12878
 SRX150638
EP300
B cells
 SRX2339191
CREBBP
GM12878
 SRX392808
EP300
Kasumi-1
 SRX747574
EP300
K-562
 SRX186770
CREBBP
K-562
 SRX116429
CREBBP
OCI-LY-7
 SRX1048478
EP300
B cells
 SRX2339193
CREBBP
Erythroid Cells
 SRX218421
EP300
K-562
 SRX150573
EP300
DOHH-2
 SRX1048455
EP300
CD4+ T cells
 SRX017698
CREBBP
CD8+ T cells
 SRX2464017
EP300
697
 SRX6909699
EP300
ICN12
 SRX656350
EP300
Acute myeloid leukemia
 SRX5930117
EP300
Acute myeloid leukemia
 SRX5930116
EP300
Macrophages
 SRX5839979
CREBBP
Macrophages
 SRX5839978
CREBBP
Macrophages
 SRX5839977
CREBBP
Macrophages
 SRX5839976
CREBBP
GM12878
 SRX475792
EP300
GM12878
 SRX475791
EP300
GM12878
 SRX475790
EP300
GM12878
 SRX475789
EP300
Kasumi-1
 SRX4472654
EP300
Kasumi-1
 SRX4472653
EP300
GM12878
 SRX392818
EP300
GM12878
 SRX392817
EP300
GM12878
 SRX392816
EP300
GM12878
 SRX392815
EP300
GM12878
 SRX392814
EP300
GM12878
 SRX392813
EP300
GM12878
 SRX392812
EP300
GM12878
 SRX392811
EP300
GM12878
 SRX392810
EP300
GM12878
 SRX392809
EP300
GM12878
 SRX392807
EP300
CUTLL1
 SRX369138
EP300
ME-1
 SRX265233
EP300
CD8+ T cells
 SRX2464018
EP300
CD8+ T cells
 SRX2464016
EP300
CD8+ T cells
 SRX2464015
EP300
RCH-ACV
 SRX2043231
EP300
SEM
 SRX2043228
EP300
K-562
 SRX186779
EP300
CD36+
 SRX170349
EP300
Hematopoietic Stem Cells
 SRX170347
EP300
Kasumi-1
 SRX1514284
EP300
K-562
 SRX150481
EP300
LP-1
 SRX1460240
EP300
OCI-LY1
 SRX130603
EP300
K-562
 SRX116434
EP300
LP-1
 SRX1140811
EP300
LP-1
 SRX1140810
EP300
GM12878
 SRX100432
EP300
NB-4
 SRX080047
EP300
CD4+ T cells
 SRX017699
EP300
Jurkat (Clone E6-1)
 SRX015827
CREBBP
GM12878
 SRX2837387
NFKB1
L-1236
 SRX790969
NFKB1
GM12878
 SRX2837388
NFKB1
L-1236
 SRX790970
NFKB1
CD4+ T cells
 SRX5371740
NFKB1
CD4+ T cells
 SRX4345365
NFKB1
RAMOS
 SRX7083404
NFKB1
CD4+ T cells
 SRX5371741
NFKB1
CD4+ T cells
 SRX4345366
NFKB1
L-1236
 SRX790972
NFKB2
L-1236
 SRX790971
NFKB2
GM12878
 SRX2837389
NFKB2
GM12878
 SRX2837390
NFKB2
K-562
 SRX186762
KAT2B
K-562
 SRX116435
KAT2B
CD4+ T cells
 SRX017700
KAT2B
GM12878
 SRX2837384
RELB
GM12878
 SRX2837383
RELB
GM12878
 SRX100408
SP1
L-1236
 SRX790968
RELB
L-1236
 SRX790967
RELB
K-562
 SRX100550
SP1
GM12878
 SRX100387
BCL3
K-562
 SRX100563
BCL3
GM12878
 SRX190236
ATF2
GM12878
 SRX100435
IRF4
GM12878
 SRX190306
CEBPB
Lymphoblastoid cell line
 SRX256995
NR3C1
Lymphoblastoid cell line
 SRX256994
NR3C1
MM.1S
 SRX327760
IRF4
GM12878
 SRX150730
IRF3
Lymphoblastoid cell line
 SRX256996
NR3C1
CAR-T cells
 SRX6800707
IRF4
MM1.RL
 SRX758135
NR3C1
K-562
 SRX150580
GTF2F1
CAR-T cells
 SRX6800702
IRF4
K-562
 SRX4708090
GTF2F1
K-562
 SRX150625
IRF1
K-562
 SRX150584
IRF1
K-562
 SRX150583
IRF1
Erythroid progenitors
 SRX687555
HDAC2
THP-1
 SRX4001954
CEBPB
SUP-B15
 SRX3436328
NR3C1
K-562
 SRX150628
IRF1
CAR-T cells
 SRX6800705
IRF4
ALL xenograft
 SRX3636818
NR3C1
Monocytes
 SRX3586325
NR3C1
OCI-AML3
 SRX3263402
CEBPB
Macrophages
 SRX1733648
ATF2
PBMC
 SRX151945
IRF5
NALM-6
 SRX959103
NR3C1
NALM-6
 SRX959102
NR3C1
NALM-6
 SRX959100
NR3C1
NALM-6
 SRX959099
NR3C1
MM1.RL
 SRX758134
NR3C1
MM.1S
 SRX758133
NR3C1
MM.1S
 SRX758132
NR3C1
U-937
 SRX7397473
IRF1
U-937
 SRX7397472
IRF1
U-937
 SRX7397471
CEBPB
U-937
 SRX7397470
CEBPB
Macrophages
 SRX716944
NR3C1
K-562
 SRX7135363
HDAC2
RAMOS
 SRX7083401
IRF4
CAR-T cells
 SRX6800711
JUN
CAR-T cells
 SRX6800710
IRF4
CAR-T cells
 SRX6800709
JUN
CAR-T cells
 SRX6800708
JUN
CAR-T cells
 SRX6800706
JUN
CAR-T cells
 SRX6800703
JUN
697
 SRX6651677
NR3C1
697
 SRX6651675
NR3C1
697
 SRX6651673
NR3C1
697
 SRX6651671
NR3C1
Acute myeloid leukemia
 SRX5930121
HDAC3
Acute myeloid leukemia
 SRX5930120
HDAC3
K-562
 SRX5646089
IRF1
K-562
 SRX5646088
IRF1
CTV-1
 SRX5574502
SMARCA4
CTV-1
 SRX5574501
SMARCA4
CTV-1
 SRX5574489
SMARCA4
CTV-1
 SRX5574488
SMARCA4
CTV-1
 SRX5574470
SMARCA4
CTV-1
 SRX5574469
SMARCA4
OCI-LY-3
 SRX518687
IRF4
OCI-LY-3
 SRX518683
IRF4
NCI-H929
 SRX518679
IRF4
OCI-LY-10
 SRX518675
IRF4
OCI-LY-3
 SRX518670
IRF4
Pre-B cells
 SRX4732741
HDAC2
MOLM-13
 SRX4525861
SMARCA4
JB6
 SRX4394541
CEBPB
JB6
 SRX4394540
CEBPB
THP-1
 SRX4001957
CEBPB
THP-1
 SRX4001956
CEBPB
THP-1
 SRX4001955
CEBPB
MOLM-13
 SRX3927294
SMARCA4
EOL-1
 SRX3927288
SMARCC1
EOL-1
 SRX3927284
SMARCA4
HL-60
 SRX3694988
HDAC2
HL-60
 SRX3694983
HDAC2
ALL xenograft
 SRX3636821
NR3C1
ALL xenograft
 SRX3636820
NR3C1
ALL xenograft
 SRX3636819
NR3C1
Macrophages
 SRX3586332
NR3C1
Macrophages
 SRX3586331
NR3C1
Macrophages
 SRX3586330
NR3C1
Macrophages
 SRX3586329
NR3C1
Monocytes
 SRX3586328
NR3C1
Monocytes
 SRX3586327
NR3C1
Monocytes
 SRX3586326
NR3C1
Peripheral blood mononuclear cells
 SRX3545884
SMARCC1
Bone marrow nuclear cells
 SRX3545880
SMARCC1
Bone marrow nuclear cells
 SRX3545876
SMARCC1
Bone marrow nuclear cells
 SRX3545872
SMARCC1
SUP-B15
 SRX3436329
NR3C1
HL-60
 SRX3434296
CEBPB
CD4+ T cells
 SRX3279750
IRF4
OCI-AML3
 SRX3263401
CEBPB
Macrophages
 SRX3244993
CEBPB
Macrophages
 SRX3244992
CEBPB
HL-60
 SRX2957422
CEBPB
J-Lat A72
 SRX2937348
SMARCA4
J-Lat A72
 SRX2937345
SMARCA4
J-Lat A72
 SRX2937342
SMARCA4
J-Lat A72
 SRX2937339
SMARCA4
THP-1
 SRX2900587
NR3C1
THP-1
 SRX2900586
NR3C1
THP-1
 SRX2900585
NR3C1