ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for TP53

Query protein: TP53
Cell class: Blood
Sort key: SRX3666504 | T cells
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs TP53's Colocalization partners

◢ TP53: Average

◢ SRX5865959: K-562

◢ SRX5865960: K-562

◢ SRX5865961: K-562

◢ SRX5865962: K-562

◢ SRX5865963: K-562

◢ SRX5865964: K-562

◢ SRX5865965: K-562

◢ SRX5865966: K-562

◢ SRX5865967: K-562

◢ SRX5865968: K-562

◢ SRX5865969: K-562

◢ SRX5865970: K-562

◢ SRX5865971: K-562

◢ SRX5865972: K-562

◢ SRX5865973: K-562

◢ SRX5865974: K-562

◢ SRX278504: Lymphoblastoid cells

◢ SRX278506: Lymphoblastoid cells

◢ SRX278507: Lymphoblastoid cells

◢ SRX278510: Lymphoblastoid cells

◢ SRX5865975: MOLM-13

◢ SRX5865976: MOLM-13

◢ SRX5865977: MOLM-13

◢ SRX5865978: MOLM-13

◢ SRX5865979: MOLM-13

◢ SRX5865980: MOLM-13

◢ SRX5865981: MOLM-13

◢ SRX5865982: MOLM-13

◢ SRX5865983: MOLM-13

◢ SRX5865984: MOLM-13

◢ SRX5865985: MOLM-13

◢ SRX5865986: MOLM-13

◢ SRX5865987: MOLM-13

◢ SRX5865988: MOLM-13

◢ SRX5865989: MOLM-13

◢ SRX5865990: MOLM-13

◢ SRX2940751: SK-MEL-5

◢ SRX3666488: T cells

◢ SRX3666490: T cells

◢ SRX3666492: T cells

◢ SRX3666494: T cells

◢ SRX3666496: T cells

◢ SRX3666498: T cells

◢ SRX3666500: T cells

◢ SRX3666502: T cells

◣ SRX3666504: T cells

◢ SRX3666506: T cells

◢ SRX3666508: T cells

◢ SRX3666510: T cells

◢ TP53: STRING

T cells
 SRX3666504
TP53
T cells
 SRX3666498
TP53
T cells
 SRX3666496
TP53
T cells
 SRX3666506
TP53
T cells
 SRX3666508
TP53
K-562
 SRX186741
SUZ12
K-562
 SRX186700
HDAC6
B cells
 SRX185893
BCL6
SU-DHL-4
 SRX1048490
MEF2B
OCI-LY-7
 SRX1048477
BACH2
GM12878
 SRX102989
MYC
OCI-LY-7
 SRX1048478
EP300
OCI-LY-7
 SRX271854
EZH2
K-562
 SRX116419
SETDB1
GM12878
 SRX150691
STAT1
K-562
 SRX4708095
CCAR2
Plasma Cells
 SRX203395
MED1
K-562
 SRX4708073
HNRNPUL1
K-562
 SRX218221
HSF2
K-562
 SRX218218
HSF2
GM12878
 SRX186610
ESRRA
HBL-1
 SRX1652873
POU2AF1
K-562
 SRX116439
KDM5B
K-562
 SRX116426
HDAC6
HBL-1
 SRX1652872
POU2AF1
T cells
 SRX3666502
TP53
T cells
 SRX3666500
TP53
DND-41
 SRX186718
EZH2
GM12878
 SRX186694
EZH2
CD20+
 SRX186666
EZH2
K-562
 SRX186648
SETDB1
SU-DHL-10
 SRX347425
STAT3
OCI-LY-3
 SRX347423
STAT3
K-562
 SRX186764
CBX3
GM12878
 SRX186622
SREBF1
K-562
 SRX186615
ZC3H11A
GM12878
 SRX150730
IRF3
GM12878
 SRX150496
SUPT20H
K-562
 SRX116427
CBX3
P493-6
 SRX148962
CDK9
Lymphoblastoid cell line
 SRX256997
RELA
P493-6
 SRX129067
MYC
K-562
 SRX150573
EP300
T cells
 SRX3666488
TP53
MOLM-13
 SRX1735799
CDK9
Jurkat
 SRX658609
MED1
Jurkat
 SRX326889
ERG
GM12878
 SRX150494
KAT2A
Macrophages
 SRX212358
EPAS1
GM12878
 SRX150636
STAT3
Macrophages
 SRX093192
EGR2
Macrophages
 SRX212351
HIF1A
K-562
 SRX150580
GTF2F1
PBDEFetal
 SRX150413
GATA1
K-562
 SRX186770
CREBBP
K-562
 SRX116429
CREBBP
Lymphoblastoid cell line
 SRX256994
NR3C1
Lymphoblastoid cell line
 SRX256998
RELA
K-562
 SRX116449
SUZ12
K-562
 SRX116448
SIRT6
K-562
 SRX116421
HDAC1
P493-6
 SRX204414
MED1
OCI-LY-10
 SRX347421
STAT3
Macrophages
 SRX212356
EPAS1
Macrophages
 SRX212355
EPAS1
Macrophages
 SRX212354
HIF1A
Macrophages
 SRX212353
HIF1A
CUTLL1
 SRX070883
RBPJ
Multiple Myeloma
 SRX129117
MED1
Macrophages
 SRX212363
EPAS1
Macrophages
 SRX212357
EPAS1
K-562
 SRX186761
NCOR1
GM12878
 SRX150731
NFE2
MV-4-11
 SRX1293532
KMT2A
KMS-28BM
 SRX6430575
EZH2
Macrophages
 SRX212352
HIF1A
KMS-28PE
 SRX6430580
EZH2
KMS-28PE
 SRX6430578
EZH2
KMS-28BM
 SRX6430573
EZH2
K-562
 SRX186772
EZH2
K-562
 SRX092299
NR4A1
GM12878
 SRX186608
SREBF2
GM04604
 SRX8066535
CTCF
K-562
 SRX092302
HDAC8
Lymphoblastoid cell line
 SRX256995
NR3C1
K-562
 SRX218220
HSF1
Jurkat
 SRX2730808
ARID5B
K-562
 SRX218228
HSF2
K-562
 SRX1491464
ASH1L
THP-1
 SRX054458
NR1H3
Macrophages
 SRX212360
HIF1A
MM1.RL
 SRX758135
NR3C1
RPMI 8226
 SRX6430588
EZH2
OCI-LY-19
 SRX347422
STAT3
CD34 Hematopoietic stem cells
 SRX3768714
MLLT3
HBL-1
 SRX1652871
POU2F2
CD34 Hematopoietic stem cells
 SRX3768713
MLLT3
TMD8
 SRX3387556
STAT3
OCI-LY1
 SRX3461647
KDM1A
OCI-LY1
 SRX3135180
BCL6
RPMI 8226
 SRX6430591
EZH2
OCI-LY1
 SRX271857
EZH2
GM04648
 SRX8066533
CTCF
CD34 Hematopoietic stem cells
 SRX3768715
MLLT3
SET-2
 SRX2961559
STAT1
Erythroblasts
 SRX3768721
MLLT3
TMD8
 SRX3387555
STAT3
Erythroid progenitors
 SRX5169134
GATA2
Erythroid Cells
 SRX1042048
SETD1A
Erythroid progenitors
 SRX687556
GATA2
HBL-1
 SRX1652870
POU2F2
K-562
 SRX895430
SUMO2
T cells
 SRX3666492
TP53
Erythroblasts
 SRX467199
NR2C2
GM08714
 SRX150409
ZNF274
MOLM-13
 SRX1735800
CDK9
Lymphoblastoid cell line
 SRX256996
NR3C1
Macrophages
 SRX212361
HIF1A
Macrophages
 SRX212365
EPAS1
K-562
 SRX186756
SIRT6
THP-1
 SRX387776
VDR
GM12878
 SRX093541
SUPT20H
BJAB
 SRX1652876
POU2F2
GM12878
 SRX150457
BRCA1
Macrophages
 SRX212362
HIF1A
P493-6
 SRX148963
CDK9
K-562
 SRX218217
HSF1
Treg
 SRX212437
ETS1
L-1236
 SRX790966
RELA
L-1236
 SRX790965
RELA
THP-1
 SRX045435
VDR
K-562
 SRX186762
KAT2B
K-562
 SRX116435
KAT2B
MM.1S
 SRX447601
CDK7
CD34+
 SRX447429
MLLT3
GRANTA-519
 SRX373874
SOX11
K-562
 SRX2442522
CUX1
K-562
 SRX218225
HSF2
MM.1S
 SRX2140215
CDKN1B
MM.1S
 SRX2140214
CDKN1B
MM.1S
 SRX2140213
CCND2
Treg
 SRX212446
FOXP3
Macrophages
 SRX212366
EPAS1
Macrophages
 SRX212364
EPAS1
Plasma Cells
 SRX203394
MAX
K-562
 SRX186674
CHD7
K-562
 SRX150625
IRF1
K-562
 SRX1491463
ASH1L
K-562
 SRX116432
NCOR1
K-562
 SRX116418
CHD7
K-562
 SRX097090
SMAD1
Macrophages
 SRX093191
EGR2
THP-1
 SRX054457
NR1H3
NALM-6
 SRX3586353
RUNX1
Macrophages
 SRX212359
HIF1A
P493-6
 SRX129087
MED1
Dendritic Cells
 SRX5095870
SPI1
CD34+
 SRX447428
KMT2A
Th17 Cells
 SRX2661483
STAT3
K-562
 SRX116425
HDAC6
P493-6
 SRX129088
MED1
GM12878
 SRX392811
EP300
K-562
 SRX7494162
HIF1A
Akata
 SRX2795369
BRD4
Plasma Cells
 SRX203390
CDK9
P493-6
 SRX148964
CDK9
Kasumi-1
 SRX698184
CEBPA
Th17 Cells
 SRX2661481
STAT3
Th17 Cells
 SRX2661479
STAT3
K-562
 SRX186706
CHD4
PBMC
 SRX151950
STAT4
THP-1
 SRX1213824
WDR5
K-562
 SRX116431
CHD4
delta-47
 SRX1091820
CTCF
U-937
 SRX097110
CEBPA
NB-4
 SRX014751
RXRA
CD8+ T cells
 SRX2464017
EP300
Mutu
 SRX2795363
BRD4
CUTLL1
 SRX515116
KDM6B
SEM
 SRX4931277
ELL2
SEM
 SRX4931276
AFF4
SEM
 SRX4931274
ELL2
SEM
 SRX4931273
AFF4
U-937
 SRX4705117
CHAF1A
MOLM-13
 SRX4705112
CHAF1A
B Lymphoblastoid cell line
 SRX2614803
DNMT3B
MOLM-13
 SRX2546005
METTL14
Pre-B cell leukemia
 SRX2323911
AFF1
Hematopoietic Stem Cells
 SRX1089827
TAL1
Hematopoietic Stem Cells
 SRX1089824
GATA1
K-562
 SRX1085072
KDM2B
REH
 SRX1085065
KDM2B
GM12878
 SRX150559
NR2C2
Macrophages
 SRX5839979
CREBBP
GM12878
 SRX392814
EP300
K-562
 SRX7494163
HIF1A
K-562
 SRX7494161
HIF1A
ALL xenograft
 SRX3636820
NR3C1
Erythroblasts
 SRX646134
EZH2
KARPAS-422
 SRX6430557
EZH2
KG-1
 SRX3599220
EZH2
HAP1
 SRX3312886
BRD4
HAP1
 SRX3312885
BRD4
MV-4-11
 SRX3031981
BRD4
Akata
 SRX2795373
BRD4
Akata
 SRX2795372
BRD4
Akata
 SRX2795370
BRD4
Akata
 SRX2795368
BRD4
Akata
 SRX2795366
BRD4
Mutu
 SRX2795365
BRD4
Mutu
 SRX1923320
BRD4
K-562
 SRX218227
HSF1
THP-1
 SRX360404
VDR
THP-1
 SRX360403
VDR
THP-1
 SRX360402
VDR
Mutu
 SRX1923325
BRD3
Mutu
 SRX1923324
BRD3
Mutu
 SRX1923323
BRD2
ME-1
 SRX3030205
RUNX1
GM06077
 SRX8066531
CTCF
THP-1
 SRX728790
CDK12
Jurkat
 SRX697746
PRKCQ
Jurkat
 SRX697745
PRKCQ
Jurkat
 SRX697744
PRKCQ
Jurkat
 SRX697743
PRKCQ
CD4+ T cells
 SRX690997
PSIP1
KBM-7
 SRX6840508
HAP1
KARPAS-422
 SRX6430558
SUZ12
B cells
 SRX5099499
STAT3
U-937
 SRX4705118
CHAF1A
U-937
 SRX4705116
CHAF1A
U-937
 SRX4705114
CHAF1A
Erythroblasts
 SRX467200
NR2C2
MV-4-11
 SRX4170733
WDR5
MV-4-11
 SRX4170731
WDR5
MV-4-11
 SRX4170725
WDR5
T cells
 SRX3942992
ZNF341
PBMC
 SRX3942989
ZNF341
B cells
 SRX3445723
ZNF341
B cells
 SRX3445722
ZNF341
HL-60
 SRX3434295
SKI
OCI-LY-10
 SRX3387558
STAT3
OCI-LY-10
 SRX3387557
STAT3
HAP1
 SRX3312899
MTHFD1
CD4+ T cells
 SRX2821737
FOSL1
MM.1S
 SRX264463
CDK7
B Lymphoblastoid cell line
 SRX2614802
DNMT3B
B Lymphoblastoid cell line
 SRX2614801
DNMT3B
B Lymphoblastoid cell line
 SRX2614800
DNMT3B
MOLM-13
 SRX2546003
METTL14
MOLM-13
 SRX2546001
METTL3
CD34+
 SRX248936
LMO2
CD4+ T cells
 SRX237290
SRCAP
Pre-B cell leukemia
 SRX2323910
AFF1
SKNO-1
 SRX1942893
ASXL2
NOMO-1
 SRX1642494
BRD9
Hematopoietic Stem Cells
 SRX1089825
TAL1
ALL-SIL
 SRX1085073
KDM2B
DND-41
 SRX1085069
KDM2B
Macrophages
 ERX2277468
CSF1R