ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for RUNX1

Query protein: RUNX1
Cell class: Blood
Sort key: SRX1261522 | TF-1
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs RUNX1's Colocalization partners

◢ RUNX1: Average

◢ SRX6909701: 697

◢ SRX1036364: Acute myeloid leukemia

◢ SRX3789538: Acute myeloid leukemia

◢ SRX3789539: Acute myeloid leukemia

◢ SRX3789540: Acute myeloid leukemia

◢ SRX3789541: Acute myeloid leukemia

◢ SRX5729922: Acute myeloid leukemia

◢ SRX5729923: Acute myeloid leukemia

◢ SRX107295: CCRF-CEM

◢ SRX107296: CCRF-CEM

◢ SRX029435: CD34+

◢ SRX062339: CD34+

◢ SRX248935: CD34+

◢ SRX212443: CD4+ T cells

◢ SRX212444: CD4+ T cells

◢ SRX029081: CMK

◢ SRX369126: CUTLL1

◢ SRX1089834: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX1089835: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX3434294: HL-60

◢ SRX1041800: Jurkat

◢ SRX1492212: Jurkat

◢ SRX2014504: Jurkat

◢ SRX206835: Jurkat

◢ SRX015826: Jurkat (Clone E6-1)

◢ SRX128782: Jurkat (Clone E6-1)

◢ SRX128783: Jurkat (Clone E6-1)

◢ SRX128784: Jurkat (Clone E6-1)

◢ SRX029083: K-562

◢ SRX029085: K-562

◢ SRX062335: Kasumi-1

◢ SRX062336: Kasumi-1

◢ SRX062337: Kasumi-1

◢ SRX062338: Kasumi-1

◢ SRX112544: Kasumi-1

◢ SRX112545: Kasumi-1

◢ SRX1514291: Kasumi-1

◢ SRX259611: Kasumi-1

◢ SRX259612: Kasumi-1

◢ SRX259621: Kasumi-1

◢ SRX259622: Kasumi-1

◢ SRX747571: Kasumi-1

◢ SRX858324: Kasumi-1

◢ SRX265222: ME-1

◢ SRX3030205: ME-1

◢ SRX3030206: ME-1

◢ SRX4393711: ME-1

◢ SRX4393712: ME-1

◢ SRX5567179: ME-1

◢ SRX5567180: ME-1

◢ SRX3586353: NALM-6

◢ SRX3586355: NALM-6

◢ SRX1803059: NB-4

◢ SRX2963102: PBMC

◢ SRX1036365: Peripheral blood stem cells

◢ SRX3586365: Pre-B lymphoblast cells

◢ SRX3586366: Pre-B lymphoblast cells

◢ SRX3586367: Pre-B lymphoblast cells

◢ SRX202967: SEM

◢ SRX063913: SKNO-1

◢ SRX1261520: TF-1

◢ SRX1261521: TF-1

◣ SRX1261522: TF-1

◢ SRX212442: Treg

◢ SRX682384: TSU-1621MT

◢ SRX952434: U-937

◢ RUNX1: STRING

TF-1
 SRX1261522
RUNX1
SKH1
 SRX3098188
MECOM
TF-1
 SRX1261523
SMC3
SKH1
 SRX3098185
MECOM
Erythroid progenitors
 SRX687554
HDAC1
Jurkat
 SRX206835
RUNX1
697
 SRX6909698
MED1
Erythroblasts
 SRX646126
SUZ12
Erythroid progenitors
 SRX687556
GATA2
Macrophages
 SRX5839977
CREBBP
ICN1
 SRX625673
IKZF1
RAMOS
 SRX1212540
TCF3
Macrophages
 SRX5839978
CREBBP
Erythroblasts
 SRX646134
EZH2
Erythroblasts
 SRX646125
EED
CD34+
 SRX386204
GFI1B
K-562
 SRX3768264
USF2
KG-1
 SRX3599221
EZH2
OCI-LY1
 SRX3461647
KDM1A
THP-1
 SRX2900591
NCOA2
Lymphoblastoid cell line
 SRX2778399
YY1
Lymphoblastoid cell line
 SRX2778398
YY1
Lymphoblastoid cell line
 SRX2778397
YY1
Lymphoblastoid cell line
 SRX2778388
YY1
THP-1
 SRX2319760
VDR
Hematopoietic Stem Cells
 SRX1089828
NFE2
ICN1
 SRX625677
IKZF1
ICN1
 SRX625676
IKZF1
Macrophages
 SRX1023797
SPI1
THP-1
 SRX1304582
LYL1
ME-1
 SRX5567175
MYH11
ME-1
 SRX4393710
MYH11
K-562
 SRX3768263
USF2
THP-1
 SRX2900590
NCOA2
Lymphoblastoid cell line
 SRX2778389
YY1
K-562
 SRX1431735
SPI1
MOLM-14
 SRX5242459
MED1
KG-1
 SRX3599220
EZH2
THP-1
 SRX2900594
NCOA2
SU-DHL-6
 SRX271858
EZH2
NOMO-1
 SRX1642494
BRD9
Pre-B ALL 
 SRX625678
IKZF1
CD4+ T cells
 SRX4345362
FOS
PBMC
 SRX3942990
ZNF341
MOLM-14
 SRX5242460
MED1
Jurkat
 SRX4705119
CHAF1A
OCI-AML3
 SRX3263401
CEBPB
WSU-DLCL2
 SRX271859
EZH2
Lymphoblastoid cell line
 SRX472275
TERF1
Peripheral blood mononuclear cells
 SRX4212578
EZH2
KG-1
 SRX3599225
SUZ12
RS4-11
 SRX151223
AFF1
GEN2.2
 SRX1491263
BRD4
CD34+
 SRX029437
TAL1
K-562
 SRX1431734
SPI1
K-562
 SRX895430
SUMO2
RAMOS
 SRX5346123
MYC
RAMOS
 SRX5346122
MYC
PBMC
 SRX5007091
BCL11B
Monocytes
 SRX3586327
NR3C1
OCI-LY1
 SRX3461646
KDM1A
Mutu
 SRX1923321
BRD4
NOMO-1
 SRX1642495
BRD9
RAMOS
 SRX5346124
MYC
HL-60
 SRX3934086
INTS13
RAMOS
 SRX5346134
WDR5
THP-1
 SRX5141103
IRF8
Kasumi-1
 SRX4472653
EP300
Multiple Myeloma
 SRX541384
EZH2
Jurkat
 SRX3927312
BRD9
Macrophages
 SRX3586329
NR3C1
RAMOS
 SRX5346135
WDR5
RAMOS
 SRX5346130
WDR5
RAMOS
 SRX5346129
WDR5
MOLM-14
 SRX5242457
MED1
MOLM-13
 SRX3927295
BRD9
HL-60
 SRX3345959
NAB2
OCI-AML3
 SRX3263402
CEBPB
Kasumi-1
 SRX3098199
CEBPA
K-562
 SRX2841998
NUP98
Macrophages
 SRX4712348
LDB1
MV-4-11
 SRX1293534
PSIP1
CD4+ T cells
 SRX4345358
NFATC2
CD4+ T cells
 SRX3279752
NFATC2
K-562
 SRX895434
SUMO2
MOLM-14
 SRX5242456
MED1
CD4+ T cells
 SRX4345365
NFKB1
Kasumi-1
 SRX4143072
TAF1
CD34+
 SRX029436
FLI1
RAMOS
 SRX5346136
WDR5
RAMOS
 SRX5346128
WDR5
REH
 SRX1898038
RAG1
GEN2.2
 SRX1491260
BRD4
Macrophages
 SRX4712347
LDB1
PBMC
 SRX5007090
BCL11B
CTV-1
 SRX5574476
SPI1
CTV-1
 SRX5574475
SPI1
Macrophages
 SRX1023796
SPI1
HUDEP-2
 SRX7584815
ATF4
MOLM-14
 SRX5242454
MED1
Kasumi-1
 SRX4390178
JUND
HL-60
 SRX3345960
NAB2
B cells
 SRX3083285
BACH2
CAL-1
 SRX1491257
BRD4
B-CLL cells
 SRX3591436
BRD4
TF-1
 SRX1261525
SMC3
CD4+ T cells
 SRX4345356
NFATC2
SKH1
 SRX3098186
MECOM
Jurkat
 SRX7785405
ATF4
Erythroblasts
 SRX7584818
ATF4
Erythroblasts
 SRX7584817
ATF4
HUDEP-2
 SRX7584814
ATF4
HUDEP-2
 SRX7584812
ATF4
HUDEP-2
 SRX7584811
ATF4
RAMOS
 SRX5346121
MYC
P493-6
 SRX5307506
MAX
MOLM-14
 SRX5242455
MED1
Macrophages
 SRX3934091
INTS13
KG-1
 SRX3599223
ZBTB16
Macrophages
 SRX3586330
NR3C1
CD34+ cells
 SRX3195440
MLLT3
HAP1
 SRX2570612
SMC1A
CAL-1
 SRX1491254
BRD4
MOLM-14
 SRX1287858
BRD4
SKNO-1
 SRX1133781
KDM1A
THP-1
 SRX6913049
BRD4
RAMOS
 SRX5346118
MYC
MO1043
 SRX2438580
NOTCH1
MV-4-11
 SRX1293535
ASH1L
SU-DHL-4
 ERX1035596
FOXP1
B cells
 SRX976244
KMT2D
HB1119
 DRX059615
KMT2B
SKH1
 SRX3098187
MECOM
OCI-LY-10
 SRX518676
SPI1
P493-6
 SRX5307508
MAX
OCI-LY-10
 SRX518675
IRF4
Macrophages
 SRX4521397
CTCF
Kasumi-1
 SRX4390177
JUND
THP-1
 SRX4001967
RELA
DLBCL
 SRX3703148
MEF2B
B-CLL cells
 SRX3591439
BRD4
HAP1
 SRX2570614
SMC1A
MO1043
 SRX2438584
NOTCH1
MV-4-11
 SRX1813527
MLLT1
B cells
 SRX1012537
FOXO1
B cells
 SRX1012536
FOXO1
ME-1
 SRX5567179
RUNX1
ME-1
 SRX4393711
RUNX1
PER-117
 SRX8472392
RUNX2
Kasumi-1
 SRX747571
RUNX1
TF-1
 SRX1261524
SMC3
ME-1
 SRX5567180
RUNX1
ME-1
 SRX4393712
RUNX1
CD34+
 SRX029435
RUNX1
Hematopoietic Stem Cells
 SRX1089825
TAL1
Hematopoietic Stem Cells
 SRX1089824
GATA1
GM12878
 SRX475791
EP300
Macrophages
 SRX5839979
CREBBP
MV-4-11
 SRX4170731
WDR5
MV-4-11
 SRX4170729
WDR5
MV-4-11
 SRX4170728
WDR5
MV-4-11
 SRX4170725
WDR5
MV-4-11
 SRX4170724
WDR5
MV-4-11
 SRX4170723
WDR5
Th17 Cells
 SRX965494
STAT3
GM04604
 SRX8066535
CTCF
GM04648
 SRX8066533
CTCF
GM06077
 SRX8066531
CTCF
K-562
 SRX7494163
HIF1A
THP-1
 SRX728776
LEO1
THP-1
 SRX728768
PAF1
Jurkat
 SRX697746
PRKCQ
Jurkat
 SRX697745
PRKCQ
Jurkat
 SRX697744
PRKCQ
Jurkat
 SRX697743
PRKCQ
SU-DHL-6
 SRX6430594
EZH2
CUTLL1
 SRX515116
KDM6B
SEM
 SRX4931277
ELL2
SEM
 SRX4931276
AFF4
U-937
 SRX4705118
CHAF1A
U-937
 SRX4705117
CHAF1A
U-937
 SRX4705114
CHAF1A
Erythroblasts
 SRX467201
NR2C2
Erythroblasts
 SRX467200
NR2C2
CD34 Hematopoietic stem cells
 SRX3768715
MLLT3
CD34 Hematopoietic stem cells
 SRX3768714
MLLT3
ALL xenograft
 SRX3636820
NR3C1
THP-1
 SRX360404
VDR
THP-1
 SRX360403
VDR
THP-1
 SRX360402
VDR
B cells
 SRX3445723
ZNF341
B cells
 SRX3445722
ZNF341
HL-60
 SRX3434295
SKI
OCI-LY-10
 SRX3387558
STAT3
TMD8
 SRX3387556
STAT3
TMD8
 SRX3387555
STAT3
HAP1
 SRX3312899
MTHFD1
HAP1
 SRX3312898
MTHFD1
HAP1
 SRX3312897
MTHFD1
HAP1
 SRX3312896
MTHFD1
HAP1
 SRX3312887
BRD4
HAP1
 SRX3312885
BRD4
HAP1
 SRX3312884
BRD4
OCI-LY1
 SRX3135180
BCL6
SET-2
 SRX2961560
STAT1